More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl102 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  307  4e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  72.44 
 
 		 157 aa  223  8e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  45.1 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  48.57 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 175 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  47.14 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.31 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  45.32 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  46.38 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.67 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  41.73 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  41.73 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  42.25 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  42.25 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.95 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  46.76 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  44.12 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 203 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  45.19 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  43.97 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  43.7 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  42.14 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  41.01 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>