More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1893 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  77.5 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  73.29 
 
 		 161 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  69.38 
 
 		 160 aa  234  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  68.99 
 
 		 164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 		 164 aa  217  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 160 aa  206  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  63.98 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  63.12 
 
 		 163 aa  200  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  60.71 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  62.26 
 
 		 166 aa  186  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  60.84 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  58.6 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  56.52 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  60.24 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  57.96 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  57.86 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  55.83 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  55.41 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  52.23 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  56.1 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  53.42 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  52.17 
 
 		 172 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  52.44 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  52.44 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  52.44 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  52.8 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  51.52 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  49.1 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  50.61 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  41.55 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  37.32 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  37.86 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  37.14 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  35.62 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  37.42 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.01 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  41.38 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  33.74 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  38.26 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  34 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  33.8 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  34.23 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>