More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05080 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  65.62 
 
 
163 aa  212  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  63.8 
 
 
164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  63.98 
 
 
160 aa  205  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  61.73 
 
 
164 aa  204  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  62.73 
 
 
160 aa  200  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 
160 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  60.49 
 
 
161 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 
166 aa  188  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  59.28 
 
 
166 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  58.68 
 
 
167 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  58.18 
 
 
164 aa  184  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  59.63 
 
 
160 aa  183  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  59.39 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  56.63 
 
 
164 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 
165 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  55.41 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.86 
 
 
160 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  52.1 
 
 
167 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
162 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 
161 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  56.49 
 
 
159 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  51.52 
 
 
172 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  51.2 
 
 
165 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 
163 aa  143  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  50 
 
 
159 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
165 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  49.4 
 
 
167 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  47.9 
 
 
164 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  47.9 
 
 
164 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  47.27 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  47.9 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  49.08 
 
 
167 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  47.88 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.79 
 
 
160 aa  103  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  38.78 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  41.26 
 
 
159 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  36.2 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.62 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  36.59 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  36.59 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  36.59 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  37.82 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  37.59 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  40 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  33.94 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  34.57 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  36.08 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  38 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  34.57 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  32.47 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  36.2 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>