More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1099 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.36 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  56.44 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  57.23 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  58.68 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  56.52 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  58.08 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  58.68 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  56.25 
 
 		 164 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  56.97 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  55.76 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  57.49 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  58.23 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  55.49 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  56.71 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  52.38 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  51.79 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  50.3 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  49.11 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  49.08 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  50.33 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.87 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.51 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.25 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  37.96 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  31.94 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  34.51 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  37.96 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  39.26 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  39.26 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  39.26 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  37.24 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  36.69 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  40.15 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  36.5 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>