More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0940 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  73.29 
 
 		 160 aa  239  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  71.43 
 
 		 160 aa  234  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  74.68 
 
 		 160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  67.74 
 
 		 160 aa  213  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  63.35 
 
 		 164 aa  210  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  63.52 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  62.35 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  60.49 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  62.05 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  60.24 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  56.71 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  59.6 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  56.63 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  55.76 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  54.37 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  56.88 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  55.21 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  57.76 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  52.76 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  52.32 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  47.31 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  47.59 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  47.31 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  48.45 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.59 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40.25 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40.25 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40.25 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  37.33 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  39.19 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  42.96 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.62 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>