More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4375 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  93.25 
 
 		 164 aa  313  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  91.41 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  88.41 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  85.37 
 
 		 164 aa  290  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  290  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  69.51 
 
 		 162 aa  229  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  67.28 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  61.73 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.5 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  56.17 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  54.04 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  53.21 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  48.8 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  52.44 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  48.47 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  49.07 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  48.78 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  49.38 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  41.32 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  46.3 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  43.21 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  45.12 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  45.12 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  45.12 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  40.49 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  38.65 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  40.65 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  37.24 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.8 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  34.81 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  33.75 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  32.17 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  34.01 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  36.65 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  32.69 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  33.96 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>