More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0251 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 157 aa  306  5e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  72.44 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  44 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  51.08 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  47.89 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  48.2 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  47.52 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  44.37 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  44.76 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  46.72 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  43.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  43.48 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  43.97 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  41.91 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.76 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  45.32 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  44.53 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  43.57 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  44.67 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  45.59 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  43.36 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.8 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  44.93 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.26 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  43.07 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  45.59 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  43.88 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  44.85 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  43.57 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  44.53 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  45.71 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  44.53 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  42.96 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46.32 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  42.34 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  42.96 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  44.2 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  43.38 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  45.14 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  45.32 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  43.57 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>