73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5324 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  58.28 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  54.19 
 
 		 159 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  51.01 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  46.25 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  43.48 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  47.56 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  45.12 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  45.12 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  45.12 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  45.12 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  43.83 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  43.83 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  42.59 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  40.37 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  38.75 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  40.25 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  38.12 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  40 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  40.37 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 167 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  37.82 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  36.59 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  38.31 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  39.26 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  37.89 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.96 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  29.22 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  32.72 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  38.95 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  30 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  28.77 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.58 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  34.04 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  28.19 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  28.19 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  33.57 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  28.77 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  26.39 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  26.85 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  26.85 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  28.03 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1813  GreA/GreB family elongation factor  31.25 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.699103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  25.69 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  35.23 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  28 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  26.17 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  28.48 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  32.24 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  28.86 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  29.25 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  26.85 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  29.41 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>