More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1813 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1813  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 158 aa  307  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.699103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0902  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  38.61 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1492  GreA/GreB family elongation factor  35.03 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.717589  hitchhiker  0.0072326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  32.91 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  32.05 
 
 		 265 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  32.05 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  29.56 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  31.68 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  32.93 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  33.54 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  32.69 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  27.63 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  27.63 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  30.49 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  32.7 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  30.82 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  30.52 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  33.97 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  31.17 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  28.31 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  29.27 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  32.52 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  34.01 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  35.17 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  34.78 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  30.52 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  35.17 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  32.52 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  29.73 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  28.12 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  31.9 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  30.49 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  32.08 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  29.11 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  31.01 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  31.29 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  30.63 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  30.77 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  28.93 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  28.03 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  29.94 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  31.21 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  27.45 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  32.46 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  29.8 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  30.07 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  28.66 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  30.32 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  29.56 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  27.85 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  29.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  29.87 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  28.4 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  32.87 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  27.52 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  29.87 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  29.87 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  31.69 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  29.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  30.94 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  29.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  32 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>