296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0902 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0902  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 162 aa  321  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  57.43 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1492  GreA/GreB family elongation factor  46.84 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.717589  hitchhiker  0.0072326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1813  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.699103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  32.03 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  33.54 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  31.1 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  32.32 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  33.75 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  33.97 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  31.54 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  32.9 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  31.79 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  30.49 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  35.56 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  33.75 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  32.32 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  28.12 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  31.1 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  31.21 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  32.64 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  31.71 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  33.54 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  33.13 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  30.49 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  31.71 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  30.63 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  32.28 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  32.88 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  28.21 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  32.91 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  32 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  30.86 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  33.54 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  32.52 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  29.81 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  31.87 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  29.81 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  29.81 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  30.63 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  28.93 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  29.11 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  27.39 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  29.63 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  30.19 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  28.66 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0226  GreA/GreB family elongation factor  30.77 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  32.43 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  33.9 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  28.03 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  36.75 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  28.57 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  27.03 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  30.82 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  32.91 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  33.64 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  27.71 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  27.71 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  28.21 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  25.9 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  29.56 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  29.56 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  29.11 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  27.85 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  28.3 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  30.95 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  29.81 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  29.45 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  28.48 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  27.85 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>