More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0226 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0226  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  35.95 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  36.6 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  35.53 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  37.25 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  34.87 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  33.97 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  34.44 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  35.06 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  31.82 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>