More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1492 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1492  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.717589  hitchhiker  0.0072326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  74.07 
 
 		 158 aa  224  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0902  GreA/GreB family elongation factor  46.84 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  39.38 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  40.52 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1813  GreA/GreB family elongation factor  35.03 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.699103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  34.84 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.55 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  32 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  31.41 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  31.41 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  30.82 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  38.98 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  31.82 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  30.97 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  32.24 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  32.5 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  34.78 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  32.1 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  32.91 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  31.68 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  35.8 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  28.67 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  31.87 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  37.12 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  33.75 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  29.49 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  33.54 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.19 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  31.48 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  32.28 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  29.81 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  31.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0170  transcription elongation factor GreB  28.95 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  30.86 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3636  transcription elongation factor GreB  28.95 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  31.87 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23040  transcription elongation factor GreB  28.95 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  26.62 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3890  transcription elongation factor GreB  26.97 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  31.87 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3509  GreA/GreB family elongation factor  28.95 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  32.03 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  31.79 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  30.97 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  31.51 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  30.97 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3809  transcription elongation factor GreB  27.63 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  32.73 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  32.17 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  30.97 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0151  transcription elongation factor GreB  26.97 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  29.75 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>