More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0770 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  319  8e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  96.13 
 
 		 265 aa  306  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  89.03 
 
 		 266 aa  285  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.31 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  38.71 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  35.53 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  40.41 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  40.67 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  40.25 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  40.54 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  38.78 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>