More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1167 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 164 aa  330  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  94.48 
 
 		 164 aa  310  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 160 aa  224  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 		 160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  63.8 
 
 		 164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  63.35 
 
 		 161 aa  210  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  66.88 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  63.25 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  66.88 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  63.12 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  62.65 
 
 		 166 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  59.64 
 
 		 167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  59.88 
 
 		 162 aa  197  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  63.46 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  61.29 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  60.24 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  59.64 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  56.36 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  56.55 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  56.36 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  56.02 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 165 aa  170  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  54.25 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  52.2 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  50.33 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  44.16 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  38.75 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  38.75 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  38.75 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  52.53 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  39.62 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 155 aa  90.9  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.98 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  47.25 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  35.85 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  40.15 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.47 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>