More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0262 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0262  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 416 aa  830    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3799  transcription termination factor Rho  61.95 
 
 		 414 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  51.21 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  56.16 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  51.79 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  53.23 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 418 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  49.27 
 
 		 503 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  52.08 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  49.88 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  48.56 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  49.15 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  48.32 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0034  transcription termination factor Rho  50.84 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  48.92 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  49.27 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  49.76 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  48.66 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  49.03 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  48.92 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  47.39 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  50.36 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  49.16 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  54.03 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  49.64 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  48.68 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  48.07 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  49.52 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  47.03 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  47.71 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  48.55 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  46.79 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  48.79 
 
 		 415 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  49.39 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  49.09 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  47.98 
 
 		 548 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  47.23 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  46.78 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  48.01 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  52.17 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  49.18 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  48.9 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  46.54 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  48.53 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  46.08 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  46.79 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  47.34 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  48.79 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  46.08 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  48.07 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  47.57 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  48.45 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  46.65 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  51.5 
 
 		 498 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  48.41 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  47.03 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1362  transcription termination factor Rho  49.15 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  0.514608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  46.08 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  49.01 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  46.86 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  51.99 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  48.07 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  49.01 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  53.15 
 
 		 605 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  45.84 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  48.91 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  52.6 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  47.83 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  51.36 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  46.76 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  47.37 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  48.07 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  47.26 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  46.89 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  46.62 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  48.79 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2038  transcription termination factor Rho  49.39 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0991025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1103  transcription termination factor Rho  47.71 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0575951  hitchhiker  0.00481193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  45.61 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  47.43 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  46.41 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  46.79 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  45.84 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  52.33 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  46.08 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  46.17 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>