More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4444 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4444  Cation/multidrug efflux pump-like protein  100 
 
 		 1044 aa  2125    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00034162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0646  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1085 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  23.72 
 
 		 1044 aa  197  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  21.38 
 
 		 1011 aa  181  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  22.35 
 
 		 1032 aa  178  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  22.85 
 
 		 1049 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1033 aa  174  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1070 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  22.03 
 
 		 1036 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  20.73 
 
 		 1059 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  22.89 
 
 		 1023 aa  164  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 1496 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  22.41 
 
 		 1048 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  21.99 
 
 		 1041 aa  162  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  20.65 
 
 		 1043 aa  160  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  22.39 
 
 		 1048 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  22.96 
 
 		 1086 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  22.88 
 
 		 1069 aa  158  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  22.8 
 
 		 1035 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  22.07 
 
 		 1038 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  22.65 
 
 		 1035 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  21.23 
 
 		 1095 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 		 1092 aa  154  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  22.9 
 
 		 1075 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  21.58 
 
 		 1044 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  22.65 
 
 		 1034 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  22.39 
 
 		 1044 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  22.38 
 
 		 1033 aa  147  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1037 aa  146  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  24.24 
 
 		 1062 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  22.66 
 
 		 1085 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  22.43 
 
 		 1042 aa  145  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1038 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  24.59 
 
 		 1012 aa  144  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1028 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  22.71 
 
 		 1085 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  24.59 
 
 		 1012 aa  144  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  22.71 
 
 		 1085 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  21.76 
 
 		 1027 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  22.71 
 
 		 1085 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  21.98 
 
 		 1036 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  21.31 
 
 		 1048 aa  141  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  21.5 
 
 		 1051 aa  140  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  22.84 
 
 		 1050 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  22.75 
 
 		 1067 aa  140  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  23.76 
 
 		 1048 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  22.08 
 
 		 1031 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  21.09 
 
 		 1043 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1040 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  22.43 
 
 		 1037 aa  137  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.78 
 
 		 1063 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1498  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1110 aa  137  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382997  hitchhiker  0.0048852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  20.99 
 
 		 1039 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  21.36 
 
 		 1018 aa  137  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2116  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1138 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1041 aa  135  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  20.49 
 
 		 1038 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1029 aa  135  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  21.25 
 
 		 1052 aa  134  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  22.42 
 
 		 1058 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1107 aa  134  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  23.18 
 
 		 1058 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  23.03 
 
 		 1025 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  20.64 
 
 		 1038 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  20.64 
 
 		 1038 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.27 
 
 		 1034 aa  132  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  23.48 
 
 		 1065 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0169  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1036 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.78043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  22.11 
 
 		 1065 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  21.52 
 
 		 1031 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  20.51 
 
 		 1038 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.56 
 
 		 1122 aa  132  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.57 
 
 		 1024 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  20.55 
 
 		 1038 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1029 aa  131  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1051 aa  131  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  22.86 
 
 		 1083 aa  131  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  21.53 
 
 		 1039 aa  131  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  22.2 
 
 		 1049 aa  131  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  20.64 
 
 		 1038 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  21.93 
 
 		 1038 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  20.88 
 
 		 1016 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  24.12 
 
 		 1037 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1048 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  20.42 
 
 		 1038 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1065 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  22.87 
 
 		 1095 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  20.62 
 
 		 1038 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1439  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1123 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0650228  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  20.49 
 
 		 1039 aa  129  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  24.14 
 
 		 1019 aa  129  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  23.36 
 
 		 1036 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  23.02 
 
 		 1069 aa  129  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1031 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  22.79 
 
 		 1068 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1029 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1470 aa  128  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0307  acriflavin resistance protein  21.97 
 
 		 1056 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641909  normal  0.615822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  20.99 
 
 		 1057 aa  128  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  21.29 
 
 		 1014 aa  128  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>