More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2952 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.33 
 
 		 1462 aa  1021    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  62.2 
 
 		 1056 aa  1331    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  64.33 
 
 		 1057 aa  1403    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  49.29 
 
 		 1064 aa  974    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  48.12 
 
 		 1076 aa  983    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 1087 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  47.63 
 
 		 1058 aa  947    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  41.02 
 
 		 1076 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  48.69 
 
 		 1072 aa  975    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1090 aa  786    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  52.78 
 
 		 1109 aa  1120    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  44.52 
 
 		 1065 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  48.75 
 
 		 1055 aa  986    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  48.95 
 
 		 1055 aa  988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  50.14 
 
 		 1057 aa  1043    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  49.33 
 
 		 1078 aa  988    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  47.51 
 
 		 1064 aa  960    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1068 aa  999    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  48.56 
 
 		 1055 aa  979    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  47.89 
 
 		 1082 aa  959    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  50.28 
 
 		 1084 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1064 aa  1024    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  48.08 
 
 		 1082 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  51 
 
 		 1064 aa  1014    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  48.95 
 
 		 1055 aa  984    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  41.02 
 
 		 1076 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1061 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  51.6 
 
 		 1072 aa  1037    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  49.71 
 
 		 1060 aa  1036    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  50.38 
 
 		 1061 aa  1042    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  49.81 
 
 		 1060 aa  1041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1068 aa  999    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  48.3 
 
 		 1081 aa  970    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  49.43 
 
 		 1082 aa  993    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  49.15 
 
 		 1063 aa  1011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  69.25 
 
 		 1122 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 1064 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  50.28 
 
 		 1084 aa  1056    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  39.81 
 
 		 1070 aa  766    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  48.19 
 
 		 1065 aa  956    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  43.28 
 
 		 1052 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  47.28 
 
 		 1072 aa  938    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  47.89 
 
 		 1082 aa  959    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  50.28 
 
 		 1084 aa  1056    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  48.66 
 
 		 1055 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  43.31 
 
 		 1073 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  49.72 
 
 		 1082 aa  1000    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  48.54 
 
 		 1084 aa  983    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1057 aa  2147    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  41.12 
 
 		 1080 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  51.5 
 
 		 1072 aa  1042    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  49.14 
 
 		 1055 aa  995    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  48.12 
 
 		 1076 aa  983    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  48.66 
 
 		 1055 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  48.76 
 
 		 1065 aa  987    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1044 aa  618  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1095 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1072 aa  569  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.61 
 
 		 1075 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1052 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 		 1049 aa  562  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1104 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.93 
 
 		 1460 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1087 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1086 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1034 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1043 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 1496 aa  370  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1011 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1050 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1038 aa  353  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1032 aa  351  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1067 aa  350  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1470 aa  350  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1041 aa  350  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1039 aa  346  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1034 aa  341  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1036 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1054 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1054 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.35 
 
 		 1024 aa  337  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1041 aa  335  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1039 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1095 aa  333  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1054 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1053 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1065 aa  332  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.93 
 
 		 1069 aa  332  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.59 
 
 		 1036 aa  330  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.6 
 
 		 1012 aa  329  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1043 aa  328  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1071 aa  328  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  26.6 
 
 		 1012 aa  327  9e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1070 aa  326  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1034 aa  324  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1048 aa  324  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  27.45 
 
 		 1028 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1066 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>