More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0077 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  53.73 
 
 
1055 aa  1151    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  59.43 
 
 
1060 aa  1247    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  53.63 
 
 
1055 aa  1147    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  56.55 
 
 
1084 aa  1231    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.57 
 
 
1056 aa  930    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.2 
 
 
1049 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  45.59 
 
 
1073 aa  939    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  55.2 
 
 
1064 aa  1146    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  43.48 
 
 
1122 aa  901    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  100 
 
 
1058 aa  2135    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  41.42 
 
 
1087 aa  836    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  56.23 
 
 
1072 aa  1181    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  57.18 
 
 
1082 aa  1203    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  57.25 
 
 
1076 aa  1212    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  42.29 
 
 
1109 aa  840    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  55.19 
 
 
1068 aa  1158    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  53.15 
 
 
1055 aa  1138    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  56.14 
 
 
1064 aa  1181    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  43.87 
 
 
1080 aa  879    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  54.14 
 
 
1078 aa  1150    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  56.5 
 
 
1084 aa  1231    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  56.67 
 
 
1064 aa  1181    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  55.19 
 
 
1068 aa  1158    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  56.85 
 
 
1065 aa  1245    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  57.48 
 
 
1061 aa  1176    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.4 
 
 
1462 aa  1092    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  48.66 
 
 
1052 aa  962    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  59.08 
 
 
1061 aa  1239    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  59.62 
 
 
1060 aa  1254    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  56.56 
 
 
1081 aa  1215    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  54.03 
 
 
1082 aa  1143    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  58.1 
 
 
1063 aa  1208    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  52.96 
 
 
1055 aa  1144    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  54.55 
 
 
1057 aa  1157    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  57.37 
 
 
1072 aa  1212    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  43.69 
 
 
1076 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  54.57 
 
 
1065 aa  1159    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  43.93 
 
 
1070 aa  907    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 
1044 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  53.47 
 
 
1072 aa  1098    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  57.37 
 
 
1082 aa  1192    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  56.55 
 
 
1084 aa  1231    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  53.63 
 
 
1055 aa  1146    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  58.03 
 
 
1064 aa  1181    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  49.33 
 
 
1065 aa  967    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  53.84 
 
 
1082 aa  1140    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  43.6 
 
 
1076 aa  884    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  57.33 
 
 
1064 aa  1183    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 
1057 aa  920    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  47.63 
 
 
1057 aa  983    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  57.41 
 
 
1072 aa  1214    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  53.54 
 
 
1055 aa  1146    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  57.25 
 
 
1076 aa  1213    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  43.19 
 
 
1090 aa  880    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  53.63 
 
 
1055 aa  1146    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  56.55 
 
 
1084 aa  1231    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  57.37 
 
 
1082 aa  1192    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 
1086 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 
1095 aa  612  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1104 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 
1072 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 
1075 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 
1087 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1052 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 
1460 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 
1043 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1050 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 
1034 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1011 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 
1044 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 
1039 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 
1038 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.7 
 
 
1024 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 
1051 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 
1032 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.58 
 
 
1049 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 
1053 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 
1071 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 
1055 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1043 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 
1041 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 
1036 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 
1496 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 
1046 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 
1065 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 
1034 aa  380  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 
1044 aa  376  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 
1040 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 
1034 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 
1039 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 
1470 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 
1040 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 
1041 aa  373  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 
1028 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1067 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1054 aa  366  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 
1028 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1054 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.97 
 
 
1050 aa  361  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>