More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1726 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  45.55 
 
 
1057 aa  915    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.83 
 
 
1056 aa  947    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.68 
 
 
1049 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  67.14 
 
 
1068 aa  1426    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  65.78 
 
 
1064 aa  1391    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  52.75 
 
 
1058 aa  1101    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  55.75 
 
 
1072 aa  1131    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  57.2 
 
 
1072 aa  1203    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  53.01 
 
 
1064 aa  1118    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 
1109 aa  821    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1055 aa  2111    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  55.64 
 
 
1060 aa  1178    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  72.55 
 
 
1082 aa  1543    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  51.28 
 
 
1052 aa  1007    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  57.73 
 
 
1065 aa  1243    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  47.08 
 
 
1076 aa  921    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  53.49 
 
 
1064 aa  1137    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  53.22 
 
 
1084 aa  1141    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.32 
 
 
1462 aa  1039    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  56.66 
 
 
1076 aa  1214    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  52.78 
 
 
1061 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  45.88 
 
 
1070 aa  932    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  54.92 
 
 
1061 aa  1172    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  55.83 
 
 
1060 aa  1186    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  56.31 
 
 
1081 aa  1203    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  72.26 
 
 
1082 aa  1540    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  54.12 
 
 
1063 aa  1149    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  46.23 
 
 
1087 aa  893    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  57.59 
 
 
1082 aa  1212    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  73.21 
 
 
1078 aa  1555    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 
1055 aa  1937    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  55.72 
 
 
1065 aa  1176    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 
1044 aa  700    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  53.21 
 
 
1072 aa  1089    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  57.59 
 
 
1082 aa  1197    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  53.22 
 
 
1084 aa  1141    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  96.4 
 
 
1055 aa  2017    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  51.81 
 
 
1057 aa  1077    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  53.58 
 
 
1064 aa  1070    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  67.14 
 
 
1068 aa  1426    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  54.49 
 
 
1064 aa  1123    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  47.47 
 
 
1080 aa  926    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  56.12 
 
 
1084 aa  1214    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  47.08 
 
 
1076 aa  920    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  58.61 
 
 
1065 aa  1183    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  49.86 
 
 
1073 aa  996    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  48.66 
 
 
1057 aa  989    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  55.73 
 
 
1072 aa  1132    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  94.12 
 
 
1055 aa  1980    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  56.91 
 
 
1076 aa  1227    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  96.4 
 
 
1055 aa  2017    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  53.22 
 
 
1084 aa  1141    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  57.59 
 
 
1082 aa  1197    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  96.68 
 
 
1055 aa  2023    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  46.17 
 
 
1090 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  94.03 
 
 
1055 aa  1980    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 
1095 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 
1052 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 
1104 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  34.12 
 
 
1087 aa  576  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 
1075 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 
1086 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1072 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.45 
 
 
1460 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  45.86 
 
 
1122 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 
1034 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 
1043 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1050 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 
1011 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.58 
 
 
1496 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 
1053 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 
1039 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 
1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 
1032 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 
1036 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 
1041 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.01 
 
 
1024 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 
1044 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 
1040 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 
1039 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 
1046 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 
1470 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 
1054 aa  383  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 
1054 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.1 
 
 
1024 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 
1051 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.77 
 
 
1069 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 
1054 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 
1026 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1027 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 
1049 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 
1034 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 
1028 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 
1070 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 
1034 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1026 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 
1065 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 
1067 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 
1044 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 
1037 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>