More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0256 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1104 aa  2241    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  65.78 
 
 		 1095 aa  1500    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1064 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  53.16 
 
 		 1075 aa  1177    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  52.71 
 
 		 1052 aa  1131    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1084 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.05 
 
 		 1460 aa  1128    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1084 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  53.06 
 
 		 1087 aa  1140    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1084 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  71.09 
 
 		 1072 aa  1597    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  71.26 
 
 		 1086 aa  1621    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.17 
 
 		 1082 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1064 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1082 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.52 
 
 		 1056 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1064 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 		 1078 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.37 
 
 		 1060 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1072 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1072 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  32.07 
 
 		 1061 aa  602  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1065 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1060 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1084 aa  595  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1072 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1068 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1068 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  32.4 
 
 		 1081 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  32.5 
 
 		 1064 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1058 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1072 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1076 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1055 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1076 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1082 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 		 1055 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1061 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.13 
 
 		 1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1122 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1073 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1055 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1055 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1055 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1055 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1055 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1082 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1082 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1064 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1065 aa  562  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1057 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1057 aa  559  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1057 aa  555  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1052 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1070 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1044 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1080 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1076 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 1462 aa  524  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1076 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1065 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1109 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1090 aa  513  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.33 
 
 		 1049 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1087 aa  493  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1034 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1095 aa  376  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 1496 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1043 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1041 aa  363  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1032 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1070 aa  356  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1011 aa  353  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1470 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1036 aa  347  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1055 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1040 aa  346  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1044 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1065 aa  342  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1071 aa  342  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1054 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1054 aa  340  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1054 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1038 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1066 aa  336  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1075 aa  336  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1083 aa  333  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1028 aa  333  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1039 aa  333  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.13 
 
 		 1069 aa  331  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 		 1062 aa  329  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.89 
 
 		 1044 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1046 aa  328  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1067 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1046 aa  322  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1028 aa  322  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.64 
 
 		 1058 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1043 aa  321  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1033 aa  321  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>