More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2583 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  55.94 
 
 		 1075 aa  1195    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  54.62 
 
 		 1052 aa  1150    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1072 aa  2170    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  71.09 
 
 		 1104 aa  1614    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.05 
 
 		 1060 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  68.93 
 
 		 1095 aa  1550    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  78.49 
 
 		 1086 aa  1760    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  55.14 
 
 		 1087 aa  1169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.94 
 
 		 1460 aa  1162    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1072 aa  633  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1060 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1084 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1084 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1084 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1064 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1064 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  33.8 
 
 		 1061 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.96 
 
 		 1056 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1065 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1064 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  33.74 
 
 		 1072 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1072 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1065 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1058 aa  592  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  33.09 
 
 		 1084 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.2 
 
 		 1082 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1068 aa  586  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  33.7 
 
 		 1064 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1072 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1068 aa  586  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1082 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1055 aa  582  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1057 aa  581  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1078 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1073 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  32.84 
 
 		 1081 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1055 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1055 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1076 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1076 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1055 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1057 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1055 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.11 
 
 		 1063 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1055 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1082 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1055 aa  572  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 		 1082 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 		 1082 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1064 aa  562  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 		 1057 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1061 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1122 aa  549  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1052 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.32 
 
 		 1462 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1044 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1070 aa  522  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1065 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1109 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1076 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1076 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1080 aa  506  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.21 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1090 aa  486  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1087 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1095 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1041 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1050 aa  365  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 1496 aa  361  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1043 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1070 aa  353  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1055 aa  350  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1065 aa  350  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1011 aa  347  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1071 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1470 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1051 aa  342  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.86 
 
 		 1069 aa  342  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1044 aa  341  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1075 aa  340  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1032 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1028 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1054 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1054 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1036 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1028 aa  335  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1054 aa  334  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1066 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 1040 aa  330  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1058 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1033 aa  328  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1038 aa  327  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1039 aa  327  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1067 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1023 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.5 
 
 		 1024 aa  325  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1034 aa  323  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1046 aa  323  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1048 aa  321  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>