More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2086 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  60.92 
 
 		 702 aa  759    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  61.76 
 
 		 684 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  59.54 
 
 		 698 aa  764    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  60.76 
 
 		 682 aa  793    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  60.09 
 
 		 691 aa  746    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  61.46 
 
 		 699 aa  786    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  60.62 
 
 		 678 aa  780    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  61.5 
 
 		 686 aa  783    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  60.09 
 
 		 663 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  61.5 
 
 		 704 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  60.71 
 
 		 707 aa  765    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  60.81 
 
 		 679 aa  765    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  60.03 
 
 		 685 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  60.67 
 
 		 685 aa  790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  58.2 
 
 		 683 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  59.94 
 
 		 663 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  57.58 
 
 		 654 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  61.93 
 
 		 665 aa  796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  59.09 
 
 		 684 aa  750    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 666 aa  1368    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  57.53 
 
 		 653 aa  721    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  60.09 
 
 		 663 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  60.4 
 
 		 704 aa  782    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  59.57 
 
 		 685 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  59.55 
 
 		 684 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  60.76 
 
 		 647 aa  791    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  58.82 
 
 		 683 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  61.14 
 
 		 686 aa  752    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  57.62 
 
 		 669 aa  722    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  78.23 
 
 		 659 aa  1081    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  62.27 
 
 		 678 aa  792    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  59.91 
 
 		 683 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  61.57 
 
 		 699 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  61.61 
 
 		 680 aa  787    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  58.87 
 
 		 672 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  60.67 
 
 		 701 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  76.69 
 
 		 660 aa  1059    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  60.85 
 
 		 653 aa  768    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  59.01 
 
 		 656 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  57.39 
 
 		 692 aa  758    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  59.2 
 
 		 687 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  52.53 
 
 		 649 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.27 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.74 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.03 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  43.03 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.39 
 
 		 635 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.05 
 
 		 645 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  42.53 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  43.16 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  43.43 
 
 		 644 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  44.44 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.22 
 
 		 637 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.94 
 
 		 650 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.58 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  40.77 
 
 		 634 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  44.83 
 
 		 628 aa  479  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  44.26 
 
 		 628 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  42.1 
 
 		 648 aa  473  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.41 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  44.43 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  43.03 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  40.46 
 
 		 635 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  43.75 
 
 		 632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  43.26 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  42.38 
 
 		 632 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  42.66 
 
 		 630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  43.77 
 
 		 645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  44.88 
 
 		 631 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  41.71 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  42.19 
 
 		 644 aa  467  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  43.71 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  41.64 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  42.69 
 
 		 655 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  42.46 
 
 		 634 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  44.46 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  42.79 
 
 		 653 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1983  DNA topoisomerase IV subunit B  44.65 
 
 		 636 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  42.81 
 
 		 631 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  43.47 
 
 		 631 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  43.79 
 
 		 628 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  42.79 
 
 		 645 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  42.86 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  41.35 
 
 		 655 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  42.15 
 
 		 641 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  43.67 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  43.67 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  44.41 
 
 		 635 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  44.25 
 
 		 631 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  40.63 
 
 		 655 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  44.39 
 
 		 631 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  43.23 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  44.25 
 
 		 631 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  43.67 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  44.25 
 
 		 631 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  44.3 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  43.69 
 
 		 628 aa  465  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  43.51 
 
 		 630 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  41.15 
 
 		 655 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  41.59 
 
 		 655 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>