More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3220 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1145  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0778193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4915  DNA topoisomerase IV subunit B  72.57 
 
 		 634 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  65.71 
 
 		 641 aa  892    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  67.99 
 
 		 628 aa  919    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0976  DNA topoisomerase IV subunit B  51.76 
 
 		 661 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00669448  normal  0.174537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0811  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1147    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000501954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  74.44 
 
 		 630 aa  1003    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  77.55 
 
 		 628 aa  1033    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4968  DNA topoisomerase IV subunit B  72.89 
 
 		 634 aa  985    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.713463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3899  DNA topoisomerase IV subunit B  88.82 
 
 		 628 aa  1151    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4963  DNA topoisomerase IV, B subunit  72.89 
 
 		 634 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2255  DNA topoisomerase IV subunit B  63.23 
 
 		 629 aa  829    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  75.16 
 
 		 631 aa  1009    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  71.02 
 
 		 640 aa  960    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  74.68 
 
 		 626 aa  999    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  73.81 
 
 		 630 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  66.72 
 
 		 629 aa  881    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2208  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  64.17 
 
 		 626 aa  868    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  64.17 
 
 		 626 aa  867    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0551  DNA topoisomerase IV subunit B  72.89 
 
 		 634 aa  990    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2094  DNA topoisomerase IV subunit B  62.16 
 
 		 628 aa  818    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.104639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1867  DNA topoisomerase IV subunit B  50.15 
 
 		 662 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0719699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4791  DNA topoisomerase IV subunit B  72.41 
 
 		 634 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  74.04 
 
 		 631 aa  995    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  74.52 
 
 		 631 aa  991    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  65.87 
 
 		 636 aa  894    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1300  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2283  DNA topoisomerase IV subunit B  64.97 
 
 		 628 aa  870    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0415043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  72.13 
 
 		 635 aa  967    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2381  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5699  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4707  DNA topoisomerase IV subunit B  73.24 
 
 		 634 aa  983    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0604  DNA topoisomerase IV subunit B  73.8 
 
 		 632 aa  986    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5696  DNA topoisomerase IV subunit B  74.04 
 
 		 629 aa  993    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0364  DNA topoisomerase IV subunit B  68.95 
 
 		 628 aa  905    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0786  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1148    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  73.49 
 
 		 630 aa  997    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 		 630 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  76.27 
 
 		 626 aa  1014    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3573  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1147    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  64.65 
 
 		 629 aa  866    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  73.49 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  64.81 
 
 		 629 aa  867    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0940  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0156854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  84.98 
 
 		 628 aa  1132    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  65.46 
 
 		 638 aa  874    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  73.49 
 
 		 630 aa  996    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  71.52 
 
 		 631 aa  956    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  74.04 
 
 		 631 aa  995    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0900  DNA topoisomerase IV subunit B  51.22 
 
 		 661 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.573565  normal  0.687535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3339  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 661 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 628 aa  1303    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  74.04 
 
 		 631 aa  995    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0919  DNA topoisomerase IV subunit B  51.86 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0180456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  67.73 
 
 		 626 aa  883    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2414  DNA topoisomerase IV subunit B  62 
 
 		 628 aa  819    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.752872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  86.1 
 
 		 631 aa  1135    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 		 630 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1748  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  65.13 
 
 		 629 aa  877    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  79.01 
 
 		 629 aa  1057    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2278  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  86.15 
 
 		 631 aa  1149    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0818  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1147    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2526  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  70.21 
 
 		 630 aa  930    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3231  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1153    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.821467  hitchhiker  0.00000484218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0758  DNA topoisomerase IV subunit B  88.98 
 
 		 628 aa  1153    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.220488  hitchhiker  0.00186834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0773  DNA topoisomerase IV subunit B  89.3 
 
 		 628 aa  1154    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.95291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  66.83 
 
 		 630 aa  911    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3327  DNA topoisomerase IV subunit B  89.14 
 
 		 628 aa  1154    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.603705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0829  DNA topoisomerase IV subunit B  51.22 
 
 		 661 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  74.52 
 
 		 631 aa  995    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2396  DNA topoisomerase IV subunit B  51.08 
 
 		 660 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65660  DNA topoisomerase IV subunit B  73.72 
 
 		 629 aa  991    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0549  DNA topoisomerase IV subunit B  86.62 
 
 		 628 aa  1136    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2360  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  78.54 
 
 		 631 aa  1048    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  88.82 
 
 		 628 aa  1176    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 		 630 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  75.64 
 
 		 626 aa  1010    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3043  DNA topoisomerase IV subunit B  86.31 
 
 		 628 aa  1119    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3354  DNA topoisomerase IV subunit B  73.41 
 
 		 629 aa  997    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.778526  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  66.03 
 
 		 632 aa  887    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2794  DNA topoisomerase IV subunit B  72.48 
 
 		 631 aa  976    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 		 630 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  73.09 
 
 		 630 aa  979    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  75.32 
 
 		 631 aa  1004    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  73.65 
 
 		 630 aa  998    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0694  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  74.2 
 
 		 631 aa  993    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1137  DNA topoisomerase IV subunit B  51.39 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1983  DNA topoisomerase IV subunit B  64.39 
 
 		 636 aa  844    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>