More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2317 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  65.28 
 
 		 704 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  69.11 
 
 		 686 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  68.87 
 
 		 698 aa  957    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  70.59 
 
 		 691 aa  955    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  60.52 
 
 		 654 aa  760    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  72.99 
 
 		 685 aa  980    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  67.42 
 
 		 704 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  67.91 
 
 		 699 aa  909    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  72.99 
 
 		 701 aa  978    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  63.72 
 
 		 707 aa  825    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  70.55 
 
 		 682 aa  986    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  74.65 
 
 		 684 aa  993    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  85.36 
 
 		 687 aa  1149    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  92.7 
 
 		 685 aa  1304    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  73.15 
 
 		 647 aa  979    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  60.62 
 
 		 663 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  59.69 
 
 		 653 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  85.84 
 
 		 683 aa  1189    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  60.77 
 
 		 663 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  68.01 
 
 		 679 aa  885    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  61.31 
 
 		 663 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  69.72 
 
 		 686 aa  971    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  62.98 
 
 		 665 aa  827    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  65.83 
 
 		 699 aa  849    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  87.01 
 
 		 684 aa  1204    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  58.82 
 
 		 666 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  60.15 
 
 		 653 aa  765    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  86.28 
 
 		 685 aa  1211    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  86.75 
 
 		 684 aa  1197    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 683 aa  1399    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  59.27 
 
 		 660 aa  789    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  59.51 
 
 		 669 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  59.26 
 
 		 659 aa  788    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  67.91 
 
 		 680 aa  909    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  70.74 
 
 		 683 aa  954    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  66.67 
 
 		 702 aa  865    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  62.23 
 
 		 672 aa  834    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  59.33 
 
 		 656 aa  760    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  59.14 
 
 		 678 aa  786    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  73.57 
 
 		 678 aa  1012    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  61.51 
 
 		 692 aa  854    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  51.37 
 
 		 649 aa  633  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.97 
 
 		 647 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.34 
 
 		 648 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  44.18 
 
 		 658 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  45.2 
 
 		 640 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  45.26 
 
 		 655 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  44.93 
 
 		 655 aa  515  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.96 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  44.95 
 
 		 655 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  44.8 
 
 		 655 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  43.77 
 
 		 636 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  44.29 
 
 		 650 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.16 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.61 
 
 		 636 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  43.66 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  44.19 
 
 		 655 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  44.22 
 
 		 640 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  45.38 
 
 		 635 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.82 
 
 		 633 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  42.88 
 
 		 655 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.95 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  43.83 
 
 		 633 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  42.15 
 
 		 634 aa  491  1e-137  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  43.55 
 
 		 628 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.15 
 
 		 627 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  43.19 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  42.94 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  41.24 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  43.28 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  42.88 
 
 		 655 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  45.09 
 
 		 638 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  44.22 
 
 		 626 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  43.03 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  43.14 
 
 		 649 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  44.67 
 
 		 633 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  42.43 
 
 		 644 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  43.36 
 
 		 632 aa  481  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.08 
 
 		 633 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  44.34 
 
 		 645 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.12 
 
 		 637 aa  480  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  42.37 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  43.3 
 
 		 645 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  42 
 
 		 647 aa  477  1e-133  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  42.15 
 
 		 642 aa  479  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  44.57 
 
 		 641 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  42.84 
 
 		 653 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  43.72 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  43.17 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  43.37 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  42.57 
 
 		 641 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  44.46 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  42.59 
 
 		 642 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  43.23 
 
 		 628 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  43.06 
 
 		 727 aa  476  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  44.57 
 
 		 641 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  43.48 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  42.05 
 
 		 643 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.09 
 
 		 637 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>