More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0036 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  646    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  50.94 
 
 
653 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  60.3 
 
 
796 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  55.05 
 
 
642 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.67 
 
 
795 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.28 
 
 
638 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  58.54 
 
 
654 aa  766    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  55.85 
 
 
638 aa  691    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  53.66 
 
 
786 aa  638    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 
643 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  84.16 
 
 
644 aa  1134    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  58.58 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.73 
 
 
654 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  54.76 
 
 
655 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  55.78 
 
 
650 aa  663    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.16 
 
 
636 aa  700    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  60.19 
 
 
641 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 
634 aa  663    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  59.06 
 
 
640 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  89.98 
 
 
649 aa  1208    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  59.56 
 
 
633 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.73 
 
 
654 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  54.25 
 
 
655 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
661 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 
655 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  62.52 
 
 
633 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.02 
 
 
650 aa  744    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.08 
 
 
642 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  59.06 
 
 
640 aa  710    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.96 
 
 
795 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 
645 aa  655    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  88.98 
 
 
644 aa  1177    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
655 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  88.98 
 
 
637 aa  1164    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 
655 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  60.93 
 
 
795 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  59.69 
 
 
640 aa  769    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  55.17 
 
 
650 aa  668    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  53.46 
 
 
655 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.11 
 
 
645 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  85.69 
 
 
644 aa  1140    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.74 
 
 
635 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.37 
 
 
634 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.6 
 
 
642 aa  709    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  90.36 
 
 
643 aa  1217    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.9 
 
 
675 aa  678    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 
649 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.13 
 
 
642 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  61.42 
 
 
632 aa  789    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  59.06 
 
 
640 aa  710    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.93 
 
 
802 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  56.78 
 
 
627 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  60.06 
 
 
644 aa  754    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 
644 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.43 
 
 
640 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  61.54 
 
 
652 aa  809    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.9 
 
 
638 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
638 aa  701    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  55.59 
 
 
637 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  59.1 
 
 
825 aa  646    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.5 
 
 
633 aa  719    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 
651 aa  680    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 
645 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.24 
 
 
651 aa  677    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  57.46 
 
 
642 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  53.93 
 
 
652 aa  654    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.54 
 
 
645 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.73 
 
 
654 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  59.94 
 
 
635 aa  723    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  58.31 
 
 
651 aa  766    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  56.47 
 
 
650 aa  664    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 
645 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  60.41 
 
 
646 aa  767    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  60.03 
 
 
628 aa  769    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
640 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.8 
 
 
658 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.96 
 
 
636 aa  663    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.87 
 
 
656 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.93 
 
 
802 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
643 aa  1324    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  54.62 
 
 
655 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.64 
 
 
641 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.36 
 
 
640 aa  705    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  51.72 
 
 
665 aa  663    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.43 
 
 
640 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
636 aa  697    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60 
 
 
794 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 
655 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>