More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0966 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.01 
 
 
655 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  56.11 
 
 
641 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.36 
 
 
635 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.05 
 
 
642 aa  650    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 
641 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  53.71 
 
 
637 aa  690    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.14 
 
 
642 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.7 
 
 
655 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  54.23 
 
 
644 aa  689    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 
641 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.89 
 
 
635 aa  642    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 
644 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 
640 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.9 
 
 
642 aa  692    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  55.28 
 
 
649 aa  686    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  51.55 
 
 
645 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  639    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  54.49 
 
 
645 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.76 
 
 
633 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 
638 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.42 
 
 
658 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  54.79 
 
 
644 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  52.77 
 
 
655 aa  655    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.96 
 
 
637 aa  674    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.78 
 
 
655 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 
640 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.57 
 
 
643 aa  682    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.63 
 
 
640 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.93 
 
 
655 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  55.18 
 
 
645 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.5 
 
 
640 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.11 
 
 
645 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.08 
 
 
634 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  53.42 
 
 
645 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.97 
 
 
641 aa  739    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
675 aa  653    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  53.65 
 
 
642 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  73.85 
 
 
627 aa  954    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.69 
 
 
632 aa  714    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  57.01 
 
 
636 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  65.78 
 
 
636 aa  857    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  55.31 
 
 
642 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.04 
 
 
644 aa  656    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  56.22 
 
 
636 aa  721    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.42 
 
 
638 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  56.18 
 
 
649 aa  687    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 
638 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 
654 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  65.62 
 
 
636 aa  858    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.35 
 
 
640 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.63 
 
 
633 aa  684    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  50.61 
 
 
656 aa  650    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 
635 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.18 
 
 
650 aa  713    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  55.32 
 
 
644 aa  679    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 
637 aa  649    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  57.35 
 
 
640 aa  709    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.79 
 
 
637 aa  695    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.12 
 
 
651 aa  648    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.13 
 
 
628 aa  708    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 
644 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53 
 
 
633 aa  659    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 
640 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  51.74 
 
 
642 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
650 aa  1332    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  57.55 
 
 
635 aa  684    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.49 
 
 
643 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.9 
 
 
665 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  55.45 
 
 
640 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.12 
 
 
633 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.4 
 
 
656 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.84 
 
 
640 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.86 
 
 
655 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  53.62 
 
 
655 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.16 
 
 
638 aa  632  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  51.23 
 
 
648 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.34 
 
 
654 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  54.25 
 
 
645 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.27 
 
 
654 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.59 
 
 
654 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  51.32 
 
 
654 aa  629  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.29 
 
 
643 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  51.38 
 
 
651 aa  631  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
647 aa  631  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 
634 aa  630  1e-179  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  51.06 
 
 
660 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>