More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0002 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 645 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  52.03 
 
 		 714 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.89 
 
 		 640 aa  723    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  53.39 
 
 		 642 aa  684    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  49.6 
 
 		 636 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  55.62 
 
 		 654 aa  704    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 638 aa  1313    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  56.08 
 
 		 643 aa  703    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  57.84 
 
 		 641 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  58.37 
 
 		 640 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.96 
 
 		 642 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  55.75 
 
 		 649 aa  709    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  54.77 
 
 		 650 aa  681    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.33 
 
 		 635 aa  695    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  57.84 
 
 		 644 aa  726    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 635 aa  644    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  58.06 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  56.03 
 
 		 642 aa  708    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.6 
 
 		 645 aa  668    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  51.95 
 
 		 675 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 		 661 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.84 
 
 		 655 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  54.05 
 
 		 661 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.37 
 
 		 633 aa  725    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  52.44 
 
 		 651 aa  660    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 		 651 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.69 
 
 		 640 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  57.39 
 
 		 640 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.62 
 
 		 649 aa  674    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  54.27 
 
 		 795 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  57.39 
 
 		 640 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55.61 
 
 		 644 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  53.2 
 
 		 655 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.97 
 
 		 637 aa  705    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.22 
 
 		 655 aa  689    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  54.53 
 
 		 657 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  56.41 
 
 		 644 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 		 665 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  58.53 
 
 		 640 aa  750    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  54.11 
 
 		 655 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.19 
 
 		 645 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  52.26 
 
 		 675 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  49.76 
 
 		 634 aa  637    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  53.98 
 
 		 648 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.04 
 
 		 634 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  58.84 
 
 		 634 aa  741    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 		 653 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.67 
 
 		 637 aa  701    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.88 
 
 		 655 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.23 
 
 		 675 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.6 
 
 		 638 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  54.77 
 
 		 635 aa  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.88 
 
 		 655 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  716    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.09 
 
 		 633 aa  726    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.43 
 
 		 632 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.93 
 
 		 655 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  53.4 
 
 		 651 aa  702    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 636 aa  672    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 636 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  53.98 
 
 		 719 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  52.26 
 
 		 675 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.2 
 
 		 644 aa  703    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.53 
 
 		 640 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  53.4 
 
 		 652 aa  684    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  57.55 
 
 		 638 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  57.39 
 
 		 638 aa  698    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  53.36 
 
 		 658 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  54.25 
 
 		 646 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.62 
 
 		 633 aa  712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.81 
 
 		 656 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 651 aa  685    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  53.43 
 
 		 641 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  51.72 
 
 		 652 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.71 
 
 		 650 aa  757    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  54.15 
 
 		 672 aa  662    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  55.68 
 
 		 642 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.22 
 
 		 650 aa  678    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  51.89 
 
 		 696 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.54 
 
 		 642 aa  681    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.43 
 
 		 628 aa  743    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.38 
 
 		 645 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  54.32 
 
 		 652 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  53.13 
 
 		 666 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  52.34 
 
 		 695 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.85 
 
 		 643 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  57.75 
 
 		 640 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  52.26 
 
 		 675 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  51.28 
 
 		 675 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.09 
 
 		 655 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.83 
 
 		 643 aa  714    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 647 aa  642    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  53.26 
 
 		 627 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  56.32 
 
 		 644 aa  719    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  53.11 
 
 		 655 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>