More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1048 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.71 
 
 
633 aa  726    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  53.77 
 
 
640 aa  687    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.65 
 
 
640 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  51.43 
 
 
642 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.89 
 
 
647 aa  662    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 
654 aa  672    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.18 
 
 
647 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.5 
 
 
643 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
665 aa  1365    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.3 
 
 
651 aa  697    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.48 
 
 
640 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  56.26 
 
 
636 aa  682    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
640 aa  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  49.78 
 
 
660 aa  657    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  697    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  51.2 
 
 
642 aa  654    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  51.11 
 
 
655 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.34 
 
 
637 aa  666    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  49.64 
 
 
686 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  50.67 
 
 
651 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.48 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  53.83 
 
 
635 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  52.3 
 
 
642 aa  691    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.45 
 
 
646 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  53.38 
 
 
636 aa  713    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.81 
 
 
642 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  53.54 
 
 
648 aa  682    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.51 
 
 
655 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  51.66 
 
 
627 aa  668    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  58.37 
 
 
633 aa  766    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 
645 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.02 
 
 
636 aa  690    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
645 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 
644 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  54.07 
 
 
655 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  50.9 
 
 
637 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  52.96 
 
 
655 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.73 
 
 
637 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 
642 aa  702    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.39 
 
 
648 aa  689    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 
658 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  50.51 
 
 
654 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  51.26 
 
 
655 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 
645 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  53.92 
 
 
644 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.42 
 
 
635 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  53.56 
 
 
634 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  54.4 
 
 
645 aa  709    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.87 
 
 
636 aa  691    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  67.46 
 
 
675 aa  949    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.32 
 
 
632 aa  766    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
658 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 
642 aa  668    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  55.36 
 
 
649 aa  727    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 
649 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.93 
 
 
644 aa  702    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.63 
 
 
640 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
644 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  50.52 
 
 
652 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 
638 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 
638 aa  657    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 
650 aa  640    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  67.94 
 
 
708 aa  985    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.37 
 
 
633 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  51.93 
 
 
651 aa  645    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.12 
 
 
650 aa  716    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.32 
 
 
640 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
645 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.26 
 
 
645 aa  669    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.22 
 
 
642 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  50.65 
 
 
696 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.86 
 
 
628 aa  778    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  50.29 
 
 
695 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  50.9 
 
 
649 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.33 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 
644 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.24 
 
 
637 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  51.72 
 
 
643 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  53.46 
 
 
641 aa  676    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54 
 
 
638 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  53.57 
 
 
641 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.05 
 
 
635 aa  678    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 
659 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  53.57 
 
 
641 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.24 
 
 
633 aa  683    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  51.26 
 
 
655 aa  654    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  52.07 
 
 
655 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.58 
 
 
655 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.22 
 
 
655 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  52.16 
 
 
652 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  70.23 
 
 
651 aa  947    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 
641 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  71.81 
 
 
656 aa  972    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 
645 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>