More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0005 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  65.3 
 
 		 633 aa  803    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  52.83 
 
 		 650 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.67 
 
 		 802 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  55.35 
 
 		 642 aa  690    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  59.35 
 
 		 795 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.15 
 
 		 636 aa  679    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  56.16 
 
 		 654 aa  711    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  57.39 
 
 		 638 aa  727    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 		 666 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  92.81 
 
 		 643 aa  1191    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  55.18 
 
 		 686 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 		 640 aa  873    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 		 654 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  61.36 
 
 		 641 aa  758    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.69 
 
 		 642 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  64.52 
 
 		 650 aa  809    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  52.5 
 
 		 653 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  55.59 
 
 		 719 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 		 640 aa  872    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 		 654 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 		 640 aa  872    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 		 654 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  55.99 
 
 		 635 aa  719    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  55.22 
 
 		 644 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  69.87 
 
 		 640 aa  868    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 		 654 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.7 
 
 		 627 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 640 aa  1320    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.72 
 
 		 642 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 		 661 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  65.99 
 
 		 638 aa  794    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 655 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  60.6 
 
 		 633 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  55.05 
 
 		 645 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  53.2 
 
 		 653 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.29 
 
 		 656 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.47 
 
 		 795 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 		 644 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  54.11 
 
 		 655 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 		 637 aa  685    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 		 655 aa  696    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  59.53 
 
 		 795 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  69.94 
 
 		 640 aa  865    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  70.35 
 
 		 640 aa  874    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 		 640 aa  872    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 		 654 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.87 
 
 		 654 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  54.33 
 
 		 655 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  56.03 
 
 		 645 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  54.65 
 
 		 634 aa  707    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 		 663 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  62.72 
 
 		 634 aa  785    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  54.52 
 
 		 655 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  56.45 
 
 		 679 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  51.49 
 
 		 675 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 		 646 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  55.12 
 
 		 651 aa  711    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 		 632 aa  750    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.74 
 
 		 655 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.29 
 
 		 794 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  60.71 
 
 		 642 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  53.3 
 
 		 647 aa  681    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 		 645 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.01 
 
 		 651 aa  665    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  56.65 
 
 		 644 aa  737    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  53.31 
 
 		 675 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  55.44 
 
 		 652 aa  723    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  63.42 
 
 		 638 aa  761    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  63.58 
 
 		 638 aa  761    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 		 636 aa  684    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.48 
 
 		 635 aa  717    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.5 
 
 		 633 aa  795    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 		 665 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  63.64 
 
 		 651 aa  801    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  52.4 
 
 		 644 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  58.9 
 
 		 652 aa  769    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  56.06 
 
 		 648 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  62.52 
 
 		 655 aa  758    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  61.46 
 
 		 640 aa  787    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  61.38 
 
 		 672 aa  759    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  52.5 
 
 		 714 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  52.11 
 
 		 649 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  64.11 
 
 		 650 aa  796    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 		 696 aa  673    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.81 
 
 		 628 aa  757    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  56.03 
 
 		 645 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  62.68 
 
 		 649 aa  774    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 		 666 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  58.02 
 
 		 802 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.43 
 
 		 643 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 640 aa  1320    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  53.16 
 
 		 675 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.75 
 
 		 655 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.25 
 
 		 654 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.55 
 
 		 658 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 		 643 aa  693    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.89 
 
 		 655 aa  678    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>