More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0029 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.6 
 
 		 649 aa  647    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.6 
 
 		 665 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  60.33 
 
 		 795 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.89 
 
 		 642 aa  689    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  62.22 
 
 		 795 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  58.41 
 
 		 654 aa  759    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 		 638 aa  692    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  60.74 
 
 		 802 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.71 
 
 		 643 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0004  DNA gyrase, B subunit  60.33 
 
 		 795 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  57.97 
 
 		 640 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  56.49 
 
 		 650 aa  673    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  58.53 
 
 		 651 aa  760    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  60.19 
 
 		 641 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 640 aa  714    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 640 aa  714    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  55.26 
 
 		 637 aa  702    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  58.44 
 
 		 640 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  57.72 
 
 		 786 aa  658    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  52.83 
 
 		 655 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.8 
 
 		 638 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.89 
 
 		 655 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 		 661 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  53.67 
 
 		 655 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  61.73 
 
 		 633 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.89 
 
 		 645 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.42 
 
 		 653 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  61.69 
 
 		 795 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 		 640 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  89.31 
 
 		 644 aa  1184    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  52.5 
 
 		 655 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 637 aa  1318    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.59 
 
 		 655 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  62.41 
 
 		 795 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  58.27 
 
 		 640 aa  768    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.29 
 
 		 642 aa  689    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 640 aa  714    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 655 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  53.96 
 
 		 645 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  61.04 
 
 		 796 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.62 
 
 		 641 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.19 
 
 		 634 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.8 
 
 		 635 aa  698    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55 
 
 		 636 aa  711    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.75 
 
 		 655 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.01 
 
 		 675 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.26 
 
 		 654 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 655 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.53 
 
 		 636 aa  707    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  89.45 
 
 		 643 aa  1197    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  61.26 
 
 		 632 aa  799    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 		 656 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.71 
 
 		 647 aa  636    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  54.96 
 
 		 650 aa  666    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  59.06 
 
 		 644 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  58.83 
 
 		 635 aa  728    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 		 644 aa  696    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 		 640 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.28 
 
 		 640 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  61.78 
 
 		 652 aa  796    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  57.8 
 
 		 638 aa  693    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  57.95 
 
 		 638 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  57.1 
 
 		 627 aa  702    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.42 
 
 		 654 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.17 
 
 		 633 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  60.03 
 
 		 646 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 658 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.08 
 
 		 651 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  54.37 
 
 		 652 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.42 
 
 		 654 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.28 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 		 634 aa  670    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  58.74 
 
 		 825 aa  645    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  56.8 
 
 		 650 aa  677    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.86 
 
 		 642 aa  729    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.08 
 
 		 642 aa  692    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.84 
 
 		 628 aa  759    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  84.7 
 
 		 644 aa  1140    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  84.25 
 
 		 644 aa  1134    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 		 636 aa  677    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.74 
 
 		 802 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  88.98 
 
 		 643 aa  1185    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  91.85 
 
 		 649 aa  1217    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 		 640 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  57.93 
 
 		 642 aa  718    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.68 
 
 		 633 aa  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 		 640 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.89 
 
 		 651 aa  661    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.41 
 
 		 794 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  52.99 
 
 		 655 aa  655    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>