More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf800 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.55 
 
 
642 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
647 aa  1338    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.71 
 
 
641 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.13 
 
 
643 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  53.01 
 
 
633 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  51.76 
 
 
650 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 
635 aa  669    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.29 
 
 
633 aa  647    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.03 
 
 
633 aa  655    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.23 
 
 
640 aa  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  54.15 
 
 
650 aa  703    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 
636 aa  652    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 
650 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  54.53 
 
 
642 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 
644 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 
634 aa  655    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.1 
 
 
640 aa  663    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.43 
 
 
634 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  53.31 
 
 
638 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  50.61 
 
 
649 aa  670    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 
632 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  51.86 
 
 
649 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  51.25 
 
 
644 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
649 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  50.78 
 
 
637 aa  636    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.49 
 
 
644 aa  661    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.3 
 
 
640 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 
636 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 
644 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
640 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.66 
 
 
633 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  53.02 
 
 
651 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  49.84 
 
 
652 aa  641    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 
647 aa  650    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 
635 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.23 
 
 
650 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.23 
 
 
640 aa  703    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  51.49 
 
 
628 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.32 
 
 
640 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.32 
 
 
640 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.3 
 
 
640 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.58 
 
 
640 aa  668    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.21 
 
 
637 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 
640 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 
636 aa  645    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 
642 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.86 
 
 
643 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  50.62 
 
 
642 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  52.74 
 
 
635 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  51.01 
 
 
672 aa  629  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  50.86 
 
 
635 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 
637 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.02 
 
 
643 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
642 aa  626  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  51.63 
 
 
638 aa  627  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 
642 aa  626  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 
637 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  51.78 
 
 
636 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 
655 aa  627  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
642 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  49.08 
 
 
651 aa  623  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 
654 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  50.39 
 
 
648 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  48.63 
 
 
654 aa  615  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 
651 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  50.53 
 
 
649 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  52.49 
 
 
638 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 
648 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  52.65 
 
 
638 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  47.18 
 
 
686 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  50.92 
 
 
661 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  50.62 
 
 
644 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  48.68 
 
 
636 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  49 
 
 
652 aa  614  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 
657 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  48.15 
 
 
659 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  50.61 
 
 
648 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 
719 aa  611  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  48.67 
 
 
637 aa  611  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  48.68 
 
 
654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  48.68 
 
 
654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.53 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 
714 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  48.55 
 
 
656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 
654 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 
654 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  49.54 
 
 
645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 
654 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  48.38 
 
 
643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 
654 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  49.77 
 
 
656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  48.01 
 
 
649 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 
670 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>