More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0087 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  58.4 
 
 
642 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  87.77 
 
 
658 aa  1177    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  73.5 
 
 
645 aa  940    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.86 
 
 
642 aa  682    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  54.8 
 
 
654 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.57 
 
 
654 aa  677    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.22 
 
 
638 aa  691    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  51.77 
 
 
666 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.67 
 
 
643 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.98 
 
 
644 aa  689    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  57.49 
 
 
794 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.43 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  56.2 
 
 
636 aa  702    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  55.38 
 
 
650 aa  659    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 
642 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  50.87 
 
 
635 aa  646    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.43 
 
 
640 aa  698    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.78 
 
 
642 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.49 
 
 
654 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  57.14 
 
 
640 aa  705    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  76.74 
 
 
641 aa  979    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  87.48 
 
 
655 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.34 
 
 
633 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  73.5 
 
 
645 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  51.94 
 
 
663 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  60.56 
 
 
638 aa  753    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  51.77 
 
 
665 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 
644 aa  668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  93.44 
 
 
655 aa  1246    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  53.59 
 
 
637 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
655 aa  1342    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  74.36 
 
 
1191 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 
636 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  55.9 
 
 
636 aa  697    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  81.75 
 
 
655 aa  1085    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  79.78 
 
 
645 aa  1008    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  81.29 
 
 
655 aa  1084    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  54.04 
 
 
656 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  59.47 
 
 
634 aa  755    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  59.66 
 
 
635 aa  727    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.64 
 
 
637 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  53.53 
 
 
675 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  57.41 
 
 
662 aa  719    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 
649 aa  636    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.17 
 
 
634 aa  654    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.17 
 
 
632 aa  740    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  54.78 
 
 
656 aa  694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.05 
 
 
646 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  54.53 
 
 
651 aa  719    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  53.16 
 
 
650 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.67 
 
 
641 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  54.95 
 
 
654 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  56.68 
 
 
644 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  697    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  55.11 
 
 
627 aa  685    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 
652 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  60.06 
 
 
638 aa  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  60.06 
 
 
638 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.31 
 
 
651 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 
665 aa  690    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.8 
 
 
654 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.2 
 
 
633 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 
640 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 
640 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.43 
 
 
651 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  52.17 
 
 
644 aa  636    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  51.55 
 
 
652 aa  641    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  55.76 
 
 
645 aa  678    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  75.43 
 
 
645 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  58.37 
 
 
642 aa  727    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.65 
 
 
650 aa  734    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  55.15 
 
 
650 aa  659    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  59.65 
 
 
644 aa  741    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  91.6 
 
 
655 aa  1219    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.57 
 
 
628 aa  744    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  55.11 
 
 
654 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.53 
 
 
633 aa  743    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  57.08 
 
 
635 aa  692    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.91 
 
 
640 aa  735    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 
643 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  87.33 
 
 
655 aa  1172    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.97 
 
 
644 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.26 
 
 
649 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  53.64 
 
 
643 aa  682    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.43 
 
 
640 aa  697    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
640 aa  704    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.02 
 
 
640 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  55.87 
 
 
727 aa  720    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  80.98 
 
 
655 aa  1079    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>