More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1109 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.43 
 
 
637 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  52.74 
 
 
655 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  55.46 
 
 
804 aa  641    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.17 
 
 
642 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  60.22 
 
 
795 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.7 
 
 
655 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  69.73 
 
 
654 aa  934    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.4 
 
 
638 aa  684    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 
636 aa  671    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.19 
 
 
643 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  52.09 
 
 
645 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 
627 aa  641    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 
640 aa  678    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  57.01 
 
 
644 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.19 
 
 
650 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1347    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.38 
 
 
642 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.91 
 
 
655 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.35 
 
 
635 aa  702    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.64 
 
 
635 aa  667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  55.56 
 
 
650 aa  734    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.02 
 
 
640 aa  715    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.52 
 
 
640 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.91 
 
 
655 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  70.81 
 
 
652 aa  933    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.99 
 
 
633 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  56.5 
 
 
645 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.48 
 
 
642 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 
640 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  54.01 
 
 
795 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.5 
 
 
640 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  59.35 
 
 
644 aa  758    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  54.14 
 
 
655 aa  697    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.53 
 
 
637 aa  749    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.53 
 
 
655 aa  703    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  59.14 
 
 
795 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  54.18 
 
 
641 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.28 
 
 
655 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.66 
 
 
645 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  50.84 
 
 
708 aa  684    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  56.32 
 
 
796 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.18 
 
 
634 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.08 
 
 
636 aa  674    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.87 
 
 
651 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 
675 aa  690    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 
645 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  52.07 
 
 
655 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  59.75 
 
 
643 aa  778    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.07 
 
 
641 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.96 
 
 
632 aa  733    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  57.43 
 
 
644 aa  767    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 
642 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.08 
 
 
636 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  58 
 
 
802 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  52.12 
 
 
653 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.2 
 
 
645 aa  658    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.57 
 
 
644 aa  699    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.31 
 
 
638 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  74.88 
 
 
652 aa  1013    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  56.17 
 
 
638 aa  691    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  56.33 
 
 
638 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  56.17 
 
 
794 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.94 
 
 
658 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.95 
 
 
633 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  52.93 
 
 
655 aa  688    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  50.23 
 
 
654 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.31 
 
 
656 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
651 aa  666    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 
645 aa  670    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.44 
 
 
634 aa  643    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.3 
 
 
665 aa  697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.37 
 
 
633 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
654 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.1 
 
 
650 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 
640 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  57.59 
 
 
649 aa  756    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.02 
 
 
628 aa  723    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
640 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.23 
 
 
649 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  58.59 
 
 
644 aa  776    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  57 
 
 
802 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 
643 aa  766    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  71.07 
 
 
651 aa  967    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  56.99 
 
 
796 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  67.08 
 
 
646 aa  905    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 
640 aa  678    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  54.52 
 
 
640 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  70.34 
 
 
659 aa  945    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 
640 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>