More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0133 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.32 
 
 		 642 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  74.57 
 
 		 645 aa  943    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.3 
 
 		 642 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.62 
 
 		 635 aa  687    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.17 
 
 		 654 aa  675    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.26 
 
 		 638 aa  680    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  50.85 
 
 		 666 aa  641    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.04 
 
 		 643 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.11 
 
 		 640 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 		 640 aa  693    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.42 
 
 		 640 aa  685    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  54.36 
 
 		 650 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  55.76 
 
 		 645 aa  687    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 640 aa  694    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 640 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 640 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 		 635 aa  638    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 		 640 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  50.7 
 
 		 663 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.22 
 
 		 650 aa  639    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  50.54 
 
 		 665 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  73.28 
 
 		 1191 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  85.8 
 
 		 655 aa  1156    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.68 
 
 		 633 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  57.65 
 
 		 641 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  73.96 
 
 		 645 aa  947    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  56.53 
 
 		 662 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.25 
 
 		 642 aa  675    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 		 646 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.91 
 
 		 642 aa  726    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 		 644 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 655 aa  1346    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 637 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  93.44 
 
 		 655 aa  1246    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.4 
 
 		 640 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  59.32 
 
 		 638 aa  742    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 640 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  80.98 
 
 		 655 aa  1081    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  79.13 
 
 		 645 aa  1005    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  80.83 
 
 		 655 aa  1088    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 636 aa  638    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  58.63 
 
 		 634 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  52.15 
 
 		 650 aa  659    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.26 
 
 		 651 aa  674    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.79 
 
 		 675 aa  693    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.66 
 
 		 636 aa  689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  56.17 
 
 		 727 aa  732    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  53.41 
 
 		 654 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.14 
 
 		 632 aa  748    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  53.56 
 
 		 654 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 649 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.19 
 
 		 644 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.27 
 
 		 640 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  53.41 
 
 		 654 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  89.62 
 
 		 655 aa  1201    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 		 634 aa  651    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 644 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  59.12 
 
 		 633 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.44 
 
 		 635 aa  723    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  53.74 
 
 		 652 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  59.75 
 
 		 638 aa  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  59.75 
 
 		 638 aa  715    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  54.8 
 
 		 656 aa  694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  54.96 
 
 		 636 aa  693    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 		 644 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.98 
 
 		 633 aa  724    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 640 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 		 719 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 		 651 aa  667    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  52.32 
 
 		 644 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 652 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.15 
 
 		 650 aa  736    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 		 642 aa  716    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  53.83 
 
 		 672 aa  635    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  55.42 
 
 		 640 aa  686    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.83 
 
 		 650 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.31 
 
 		 644 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  85.95 
 
 		 655 aa  1161    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.96 
 
 		 628 aa  735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 665 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  87.46 
 
 		 658 aa  1180    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 		 640 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.11 
 
 		 637 aa  697    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 		 643 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  75.89 
 
 		 641 aa  980    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  53.72 
 
 		 654 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  53.55 
 
 		 649 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 627 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.11 
 
 		 640 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  74.42 
 
 		 645 aa  943    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  52.85 
 
 		 643 aa  672    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  54.14 
 
 		 651 aa  714    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  80.67 
 
 		 655 aa  1084    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>