More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1416 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.13 
 
 
640 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  53.2 
 
 
642 aa  686    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  56.39 
 
 
640 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  92.47 
 
 
666 aa  1240    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  973    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 
633 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  55.3 
 
 
640 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  67.4 
 
 
653 aa  903    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  973    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  974    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  52.94 
 
 
645 aa  652    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  55.71 
 
 
647 aa  713    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.39 
 
 
640 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  974    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  65.67 
 
 
674 aa  887    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.95 
 
 
637 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  71.25 
 
 
654 aa  968    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  54.17 
 
 
633 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  52.01 
 
 
649 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  974    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  55.73 
 
 
642 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  51.77 
 
 
655 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  55.38 
 
 
637 aa  694    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 
640 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  973    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  51.74 
 
 
636 aa  661    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  71.88 
 
 
656 aa  975    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.82 
 
 
644 aa  685    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  55.34 
 
 
643 aa  718    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.45 
 
 
634 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
663 aa  1353    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  55.16 
 
 
641 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  71.72 
 
 
654 aa  976    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  55.08 
 
 
635 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  55.13 
 
 
637 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  53.16 
 
 
632 aa  669    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.28 
 
 
636 aa  660    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  54.79 
 
 
636 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  968    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  51.96 
 
 
644 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  72.32 
 
 
645 aa  964    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.44 
 
 
638 aa  670    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 
638 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.14 
 
 
638 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 
636 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.9 
 
 
633 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  69.47 
 
 
644 aa  932    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.95 
 
 
650 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  65.64 
 
 
674 aa  840    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  54.86 
 
 
640 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  66.67 
 
 
661 aa  897    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  54.06 
 
 
642 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  65.33 
 
 
687 aa  844    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  68.97 
 
 
649 aa  907    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 
640 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.85 
 
 
628 aa  683    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  71.1 
 
 
654 aa  973    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 
640 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 
644 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 
640 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  71.25 
 
 
654 aa  976    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
665 aa  1357    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
647 aa  634  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 
644 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  53.14 
 
 
640 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.97 
 
 
642 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  51.79 
 
 
648 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.01 
 
 
658 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  50.54 
 
 
655 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.78 
 
 
638 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  50.39 
 
 
655 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  52.89 
 
 
643 aa  628  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.76 
 
 
627 aa  625  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2326  DNA topoisomerase IV subunit B  47.85 
 
 
648 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2040  DNA topoisomerase IV subunit B  47.85 
 
 
648 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  51.47 
 
 
655 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  50.55 
 
 
637 aa  626  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  51.02 
 
 
643 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  51.01 
 
 
655 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  50.78 
 
 
649 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 
643 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 
655 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
637 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.43 
 
 
675 aa  615  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  51.82 
 
 
635 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  50.47 
 
 
635 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  48.04 
 
 
665 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
644 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  50.7 
 
 
655 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  51.78 
 
 
651 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  51.71 
 
 
650 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  50.86 
 
 
655 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  51.09 
 
 
650 aa  611  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  51.81 
 
 
641 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  51.81 
 
 
641 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>