More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3069 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 1191 aa  2468    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  87.62 
 
 		 641 aa  852    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  74.66 
 
 		 658 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  72.39 
 
 		 655 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  79.49 
 
 		 645 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  72.39 
 
 		 655 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  83.63 
 
 		 645 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  71.65 
 
 		 655 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  73.28 
 
 		 655 aa  737    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  74.36 
 
 		 655 aa  737    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  72.64 
 
 		 655 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  75.35 
 
 		 645 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4372  XRE family transcriptional regulator  55.55 
 
 		 1188 aa  1316    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00730956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  74.16 
 
 		 655 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  72.64 
 
 		 655 aa  738    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3961  DNA gyrase subunit B  79.86 
 
 		 891 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  72.64 
 
 		 655 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  87.62 
 
 		 641 aa  852    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  81.46 
 
 		 645 aa  796    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  59.56 
 
 		 632 aa  597  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.96 
 
 		 650 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  58.76 
 
 		 644 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  56.83 
 
 		 637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  57.68 
 
 		 636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  63.1 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  62.25 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  58.68 
 
 		 794 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.8 
 
 		 641 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.23 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  60.44 
 
 		 633 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  58.7 
 
 		 649 aa  569  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  59.24 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  57.01 
 
 		 727 aa  566  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.64 
 
 		 633 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.71 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  61.65 
 
 		 640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  57.09 
 
 		 802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.82 
 
 		 633 aa  563  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  58.72 
 
 		 795 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.57 
 
 		 640 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  57.54 
 
 		 645 aa  559  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  59.2 
 
 		 635 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  57.97 
 
 		 795 aa  559  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  58.6 
 
 		 642 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  57.31 
 
 		 796 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  57.2 
 
 		 642 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  58.23 
 
 		 795 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  55.32 
 
 		 656 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  57.31 
 
 		 796 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  57.83 
 
 		 802 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.6 
 
 		 634 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  56.21 
 
 		 825 aa  550  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  60.6 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  55.8 
 
 		 662 aa  546  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  56.32 
 
 		 651 aa  546  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  54.87 
 
 		 648 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  55.09 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  53.83 
 
 		 665 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  57.2 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  54.51 
 
 		 651 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  60.92 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  60.72 
 
 		 638 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  56.89 
 
 		 637 aa  538  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  56.89 
 
 		 645 aa  537  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1905  DNA gyrase, B subunit  54.76 
 
 		 821 aa  536  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.222448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.87 
 
 		 642 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  56.43 
 
 		 808 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  55.64 
 
 		 648 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  54.7 
 
 		 659 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.31 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  56.11 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  54.22 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  56 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.42 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0005  DNA gyrase, B subunit  58 
 
 		 808 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 		 652 aa  531  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  57.65 
 
 		 651 aa  530  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  54.65 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.64 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  56.04 
 
 		 641 aa  529  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  55.45 
 
 		 814 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.2 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  55.2 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  55.82 
 
 		 637 aa  527  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.29 
 
 		 642 aa  529  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0819  DNA gyrase, B subunit  55.56 
 
 		 817 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.829459  normal  0.98352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  55.49 
 
 		 815 aa  529  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.6 
 
 		 643 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  54.38 
 
 		 652 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  54.64 
 
 		 636 aa  527  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  55.69 
 
 		 811 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  60.64 
 
 		 636 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2472  DNA gyrase, B subunit  55.8 
 
 		 794 aa  523  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000184576  decreased coverage  0.00000743586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 		 879 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  55.34 
 
 		 643 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  55.51 
 
 		 661 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.43 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>