More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0087 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 		 647 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  54.15 
 
 		 647 aa  703    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  51.27 
 
 		 654 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.67 
 
 		 643 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.35 
 
 		 649 aa  656    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  57.81 
 
 		 640 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.43 
 
 		 640 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.81 
 
 		 640 aa  703    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  54.78 
 
 		 650 aa  671    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  57.96 
 
 		 640 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  57.96 
 
 		 640 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  50.69 
 
 		 645 aa  641    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  52.09 
 
 		 635 aa  665    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  57.81 
 
 		 640 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  54.13 
 
 		 637 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.78 
 
 		 640 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.18 
 
 		 633 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.52 
 
 		 651 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.25 
 
 		 642 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.89 
 
 		 640 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 633 aa  692    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51 
 
 		 649 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  51.09 
 
 		 636 aa  668    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.7 
 
 		 640 aa  686    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  57.96 
 
 		 640 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  51.08 
 
 		 641 aa  646    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  51.79 
 
 		 634 aa  659    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  57.96 
 
 		 640 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  53.27 
 
 		 634 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 		 641 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  54.4 
 
 		 642 aa  686    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.89 
 
 		 640 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.6 
 
 		 675 aa  644    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  53.18 
 
 		 632 aa  660    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  54.67 
 
 		 644 aa  684    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.09 
 
 		 636 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 		 636 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  51.99 
 
 		 644 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.51 
 
 		 640 aa  713    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  50.76 
 
 		 644 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  51.38 
 
 		 652 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 		 638 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.89 
 
 		 642 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 638 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.57 
 
 		 650 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 650 aa  1332    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 643 aa  635    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  52.01 
 
 		 637 aa  667    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.62 
 
 		 633 aa  673    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.11 
 
 		 640 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  53.88 
 
 		 651 aa  671    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51.24 
 
 		 637 aa  653    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  53.4 
 
 		 652 aa  672    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  54.24 
 
 		 655 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  52.31 
 
 		 672 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  53.26 
 
 		 635 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  54.35 
 
 		 635 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  55.96 
 
 		 650 aa  679    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  51.31 
 
 		 642 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.64 
 
 		 628 aa  683    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.34 
 
 		 642 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  50.61 
 
 		 642 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 		 638 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  57.98 
 
 		 640 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 		 637 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.56 
 
 		 633 aa  674    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  57.96 
 
 		 640 aa  704    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  58.11 
 
 		 640 aa  698    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  50.85 
 
 		 642 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  51.22 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  49.07 
 
 		 636 aa  632  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  50.76 
 
 		 645 aa  632  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  51.52 
 
 		 661 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  50.08 
 
 		 651 aa  634  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.38 
 
 		 653 aa  634  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  53.23 
 
 		 636 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  49.25 
 
 		 654 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  49.07 
 
 		 645 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  51.22 
 
 		 655 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  47.34 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  51.59 
 
 		 649 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.69 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  48.17 
 
 		 685 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.15 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.38 
 
 		 646 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 		 714 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  50.91 
 
 		 649 aa  626  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.69 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  51.85 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 647 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 651 aa  622  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.18 
 
 		 627 aa  623  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 		 655 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50.99 
 
 		 655 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 		 655 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 		 638 aa  618  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  50.53 
 
 		 655 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 		 675 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 		 675 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  48.62 
 
 		 675 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>