More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0006 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 640 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  65.3 
 
 		 686 aa  808    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.12 
 
 		 633 aa  742    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 		 642 aa  667    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.03 
 
 		 795 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  53.4 
 
 		 654 aa  668    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.76 
 
 		 638 aa  664    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.79 
 
 		 635 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  56.81 
 
 		 643 aa  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 		 636 aa  689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 		 640 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  54.85 
 
 		 644 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  56.57 
 
 		 650 aa  677    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  61.75 
 
 		 696 aa  792    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 		 649 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 640 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 640 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.46 
 
 		 635 aa  637    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.33 
 
 		 643 aa  680    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.57 
 
 		 640 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  78.21 
 
 		 661 aa  1004    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.89 
 
 		 644 aa  736    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  58.71 
 
 		 633 aa  727    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 		 640 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.11 
 
 		 642 aa  672    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.29 
 
 		 795 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 		 644 aa  661    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  51.37 
 
 		 655 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  55.02 
 
 		 637 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  52.41 
 
 		 655 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  60.11 
 
 		 795 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.03 
 
 		 642 aa  687    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 640 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 		 640 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  57.23 
 
 		 645 aa  681    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.16 
 
 		 654 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.23 
 
 		 645 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  65.27 
 
 		 695 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 		 675 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.32 
 
 		 634 aa  690    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  73.51 
 
 		 679 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 		 675 aa  699    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  53.41 
 
 		 646 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.14 
 
 		 632 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 656 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  73.68 
 
 		 719 aa  922    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  59.38 
 
 		 642 aa  728    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  66.32 
 
 		 714 aa  892    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 		 675 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  60.59 
 
 		 644 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.48 
 
 		 638 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  53.34 
 
 		 652 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.51 
 
 		 638 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  54.63 
 
 		 653 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.36 
 
 		 638 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  73.37 
 
 		 648 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  71.69 
 
 		 652 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.78 
 
 		 627 aa  643    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  57.12 
 
 		 640 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  57.12 
 
 		 640 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 645 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.42 
 
 		 633 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  57.88 
 
 		 651 aa  684    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.1 
 
 		 637 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 		 640 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.35 
 
 		 665 aa  677    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.5 
 
 		 640 aa  729    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  56.11 
 
 		 640 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.74 
 
 		 802 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 		 650 aa  697    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  65.17 
 
 		 696 aa  851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  60.93 
 
 		 628 aa  775    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.11 
 
 		 635 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.4 
 
 		 794 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  51.4 
 
 		 651 aa  658    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  70.56 
 
 		 666 aa  908    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  54.25 
 
 		 636 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 		 645 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.8 
 
 		 643 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  61.31 
 
 		 711 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.56 
 
 		 644 aa  685    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 		 675 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  67.66 
 
 		 675 aa  887    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 		 675 aa  880    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 		 654 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.47 
 
 		 642 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.67 
 
 		 641 aa  724    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.75 
 
 		 649 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.13 
 
 		 636 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 650 aa  650    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 		 650 aa  716    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  67.41 
 
 		 685 aa  847    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.29 
 
 		 651 aa  663    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>