More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0016 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 		 642 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.27 
 
 		 640 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.68 
 
 		 638 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 642 aa  678    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.67 
 
 		 795 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  54 
 
 		 655 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  57.61 
 
 		 654 aa  758    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  55.75 
 
 		 638 aa  688    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.22 
 
 		 643 aa  658    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.31 
 
 		 641 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  58.15 
 
 		 640 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.26 
 
 		 654 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 649 aa  1338    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  55.99 
 
 		 650 aa  669    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  59.09 
 
 		 640 aa  772    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  54.04 
 
 		 655 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 640 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 640 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  59.81 
 
 		 644 aa  749    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  58.78 
 
 		 640 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 		 636 aa  703    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.32 
 
 		 645 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.39 
 
 		 641 aa  640    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  56.62 
 
 		 627 aa  697    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  53.82 
 
 		 661 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  54.04 
 
 		 655 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  61.26 
 
 		 633 aa  768    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.54 
 
 		 642 aa  716    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.33 
 
 		 640 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.03 
 
 		 794 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.36 
 
 		 795 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  84.82 
 
 		 644 aa  1144    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  88.91 
 
 		 644 aa  1184    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  53.55 
 
 		 655 aa  657    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  91.85 
 
 		 637 aa  1197    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 		 655 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  61.3 
 
 		 795 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  57.59 
 
 		 651 aa  756    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  58.35 
 
 		 786 aa  646    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 640 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  53.62 
 
 		 655 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.03 
 
 		 656 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  85.31 
 
 		 644 aa  1139    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.26 
 
 		 654 aa  641    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.71 
 
 		 634 aa  703    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  58.62 
 
 		 640 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  52.26 
 
 		 636 aa  658    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  57.89 
 
 		 825 aa  635    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.4 
 
 		 641 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 		 675 aa  670    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.27 
 
 		 638 aa  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.62 
 
 		 655 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  61.26 
 
 		 632 aa  791    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.99 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.86 
 
 		 647 aa  640    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.26 
 
 		 654 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.57 
 
 		 651 aa  667    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.27 
 
 		 640 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.62 
 
 		 640 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.76 
 
 		 644 aa  703    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.05 
 
 		 649 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  59.84 
 
 		 646 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  60.62 
 
 		 652 aa  791    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.96 
 
 		 638 aa  706    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.81 
 
 		 638 aa  705    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.99 
 
 		 633 aa  732    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  91.04 
 
 		 643 aa  1211    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.76 
 
 		 633 aa  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  58.83 
 
 		 635 aa  720    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  55.87 
 
 		 650 aa  673    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.71 
 
 		 651 aa  688    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  53.3 
 
 		 652 aa  649    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.77 
 
 		 645 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.42 
 
 		 654 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.9 
 
 		 665 aa  651    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  60.19 
 
 		 802 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  56.62 
 
 		 650 aa  675    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  57.95 
 
 		 642 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 		 637 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.87 
 
 		 628 aa  760    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 		 654 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.96 
 
 		 635 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  55.66 
 
 		 634 aa  675    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 		 655 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.74 
 
 		 802 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  89.98 
 
 		 643 aa  1208    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.77 
 
 		 655 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.01 
 
 		 645 aa  657    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  60.04 
 
 		 796 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 		 658 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  55 
 
 		 636 aa  701    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.7 
 
 		 642 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>