More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1622 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  45.47 
 
 		 804 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  45.47 
 
 		 804 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  43.64 
 
 		 832 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  50.25 
 
 		 795 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  45.51 
 
 		 806 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  44.54 
 
 		 804 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  47.03 
 
 		 804 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  47.01 
 
 		 805 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  44.92 
 
 		 842 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.06 
 
 		 794 aa  739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  45.98 
 
 		 814 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  48.13 
 
 		 769 aa  699    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  45.24 
 
 		 804 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 810 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  47.01 
 
 		 805 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  45.24 
 
 		 805 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  48.26 
 
 		 769 aa  701    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  46.69 
 
 		 807 aa  688    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 851 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.49 
 
 		 805 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  46.37 
 
 		 805 aa  675    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  45.26 
 
 		 805 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0004  DNA gyrase subunit B  43.53 
 
 		 871 aa  646    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0729554  hitchhiker  0.0000403413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0003  DNA gyrase subunit B  44.79 
 
 		 834 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0123108  hitchhiker  0.00974324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0003  DNA gyrase subunit B  43.67 
 
 		 841 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  46.92 
 
 		 770 aa  648    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  44.84 
 
 		 807 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  46.57 
 
 		 810 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  46 
 
 		 806 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  46.48 
 
 		 807 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  45.5 
 
 		 805 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  45.11 
 
 		 805 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  49.56 
 
 		 795 aa  728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  44.66 
 
 		 824 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  60.26 
 
 		 644 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  53.66 
 
 		 643 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  57.72 
 
 		 637 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.82 
 
 		 805 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  50 
 
 		 795 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  48.88 
 
 		 797 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  45.59 
 
 		 813 aa  672    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 		 769 aa  644    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  46.82 
 
 		 810 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 810 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  44.72 
 
 		 812 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  45.38 
 
 		 822 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  47.35 
 
 		 795 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  46.79 
 
 		 768 aa  652    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.61 
 
 		 641 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  45.43 
 
 		 804 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  43.13 
 
 		 798 aa  637    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  46.88 
 
 		 805 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  44.03 
 
 		 870 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  46.23 
 
 		 808 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  44.64 
 
 		 811 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  45.51 
 
 		 798 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  44.96 
 
 		 807 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4460  DNA gyrase subunit B  43.65 
 
 		 823 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318757  normal  0.407237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  47.51 
 
 		 805 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.3 
 
 		 632 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  47.39 
 
 		 795 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  45.91 
 
 		 805 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  45.58 
 
 		 806 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  44.31 
 
 		 871 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0003  DNA gyrase subunit B  43.79 
 
 		 841 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  44.62 
 
 		 802 aa  636    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  45.4 
 
 		 879 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  45.05 
 
 		 805 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  46.88 
 
 		 805 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  45.03 
 
 		 824 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  47.38 
 
 		 805 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  46.9 
 
 		 806 aa  660    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  44.35 
 
 		 815 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  48.13 
 
 		 769 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  44.9 
 
 		 809 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4146  DNA gyrase subunit B  44.63 
 
 		 868 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  46.26 
 
 		 807 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  47.14 
 
 		 805 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  47.14 
 
 		 805 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  47.51 
 
 		 805 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  46.81 
 
 		 805 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 822 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  45.51 
 
 		 806 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  44.66 
 
 		 824 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  45.88 
 
 		 806 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  46.93 
 
 		 798 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  45.36 
 
 		 805 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  45.03 
 
 		 824 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.65 
 
 		 628 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  57.69 
 
 		 808 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  45.28 
 
 		 812 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  47.14 
 
 		 805 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  48.04 
 
 		 773 aa  651    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 802 aa  713    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>