More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2993 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  57.59 
 
 
640 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  57.87 
 
 
640 aa  705    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.21 
 
 
643 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.52 
 
 
642 aa  683    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  55.28 
 
 
644 aa  700    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  55.17 
 
 
654 aa  695    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  55.38 
 
 
638 aa  692    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 
666 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  57.9 
 
 
643 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  57.87 
 
 
640 aa  705    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.25 
 
 
633 aa  749    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  58.03 
 
 
640 aa  705    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.59 
 
 
641 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  52.43 
 
 
654 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  55.14 
 
 
650 aa  659    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 
653 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  55.97 
 
 
656 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  57.87 
 
 
640 aa  705    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  57.87 
 
 
640 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.19 
 
 
635 aa  640    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  56.11 
 
 
651 aa  701    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  58.03 
 
 
640 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.8 
 
 
642 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.85 
 
 
653 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  55.85 
 
 
661 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  73.95 
 
 
655 aa  966    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  52.75 
 
 
654 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  60.37 
 
 
633 aa  739    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  80.78 
 
 
645 aa  1041    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.9 
 
 
644 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  54.13 
 
 
665 aa  696    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55.36 
 
 
644 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  74.57 
 
 
655 aa  976    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.27 
 
 
637 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  75.43 
 
 
655 aa  979    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 
644 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  75.85 
 
 
658 aa  991    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  53.06 
 
 
654 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  57.87 
 
 
640 aa  705    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  56.11 
 
 
662 aa  705    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  73.26 
 
 
655 aa  970    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  78.91 
 
 
645 aa  1010    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.57 
 
 
646 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  79.97 
 
 
641 aa  1017    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  73.88 
 
 
655 aa  980    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  59.59 
 
 
634 aa  742    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.7 
 
 
645 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  54.8 
 
 
650 aa  686    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  58.51 
 
 
640 aa  749    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  54.05 
 
 
675 aa  710    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.59 
 
 
627 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  61.9 
 
 
638 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.19 
 
 
640 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  59.41 
 
 
632 aa  769    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  57.21 
 
 
635 aa  704    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 
634 aa  675    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  58.81 
 
 
794 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  52.59 
 
 
654 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  57.59 
 
 
644 aa  738    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  57.01 
 
 
636 aa  714    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  53.72 
 
 
648 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 
652 aa  719    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  60.81 
 
 
638 aa  712    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  60.65 
 
 
638 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.83 
 
 
642 aa  686    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3961  DNA gyrase subunit B  77.63 
 
 
891 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  57.32 
 
 
636 aa  719    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.47 
 
 
633 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  57.59 
 
 
640 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  57.41 
 
 
651 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
645 aa  1321    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  54.82 
 
 
652 aa  677    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  76.59 
 
 
655 aa  1002    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  56.44 
 
 
655 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  52.9 
 
 
654 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  55.84 
 
 
672 aa  657    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.44 
 
 
640 aa  707    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  53.36 
 
 
649 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  55.99 
 
 
650 aa  666    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  79.49 
 
 
1191 aa  772    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.45 
 
 
628 aa  744    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  55.77 
 
 
649 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  55.36 
 
 
649 aa  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  58.44 
 
 
640 aa  709    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  53.41 
 
 
719 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 
636 aa  668    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.54 
 
 
643 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  74.11 
 
 
655 aa  966    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  58.54 
 
 
635 aa  696    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  55.9 
 
 
727 aa  726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  58.76 
 
 
640 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  80.62 
 
 
645 aa  1033    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  55.57 
 
 
651 aa  722    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  74.19 
 
 
655 aa  980    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>