More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4195 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.03 
 
 		 642 aa  708    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.94 
 
 		 637 aa  666    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.32 
 
 		 642 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.21 
 
 		 650 aa  726    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  49.54 
 
 		 654 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.36 
 
 		 643 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 652 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.32 
 
 		 640 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 650 aa  635    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 		 634 aa  637    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  688    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.99 
 
 		 657 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  55.76 
 
 		 640 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.02 
 
 		 644 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 		 637 aa  673    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  55.92 
 
 		 636 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 		 633 aa  658    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 		 661 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  53.76 
 
 		 654 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.54 
 
 		 633 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.23 
 
 		 640 aa  690    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.35 
 
 		 633 aa  718    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  53.54 
 
 		 649 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  51.48 
 
 		 642 aa  660    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 		 642 aa  686    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.5 
 
 		 642 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  49.15 
 
 		 644 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  53.86 
 
 		 661 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.55 
 
 		 647 aa  637    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.64 
 
 		 636 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  56.62 
 
 		 637 aa  688    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 		 686 aa  650    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.77 
 
 		 634 aa  712    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.65 
 
 		 649 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.09 
 
 		 640 aa  695    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  79.97 
 
 		 636 aa  1056    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.28 
 
 		 640 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 632 aa  712    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  54.63 
 
 		 647 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.91 
 
 		 641 aa  683    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  51.99 
 
 		 651 aa  641    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 		 651 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 646 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 		 649 aa  695    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 644 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.57 
 
 		 643 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 652 aa  678    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.86 
 
 		 638 aa  693    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.7 
 
 		 638 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  53.59 
 
 		 635 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.12 
 
 		 651 aa  644    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.62 
 
 		 642 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  53.7 
 
 		 648 aa  672    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 		 636 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.81 
 
 		 633 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.82 
 
 		 645 aa  671    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 		 641 aa  642    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 651 aa  670    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.28 
 
 		 640 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 		 643 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  56.85 
 
 		 636 aa  711    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 		 638 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  52.31 
 
 		 644 aa  643    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 650 aa  641    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.64 
 
 		 628 aa  726    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.16 
 
 		 642 aa  691    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  56.38 
 
 		 640 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 653 aa  1357    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.1 
 
 		 648 aa  660    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  688    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 		 643 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  52.34 
 
 		 644 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  54.34 
 
 		 635 aa  672    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  51.01 
 
 		 659 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 640 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  96.59 
 
 		 645 aa  1307    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  61.89 
 
 		 640 aa  790    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51.81 
 
 		 637 aa  645    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 		 645 aa  633  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.42 
 
 		 637 aa  632  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 		 650 aa  634  1e-180  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 665 aa  633  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.74 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.93 
 
 		 647 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  47.34 
 
 		 655 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 656 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.96 
 
 		 675 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 666 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  52.71 
 
 		 648 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 649 aa  628  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  50.22 
 
 		 681 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  50.3 
 
 		 696 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  51.05 
 
 		 695 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>