More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4986 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  69.3 
 
 		 659 aa  942    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 796 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  53.93 
 
 		 645 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 		 642 aa  661    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  58.69 
 
 		 795 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.28 
 
 		 642 aa  662    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  70.87 
 
 		 654 aa  954    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 		 638 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.3 
 
 		 643 aa  677    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  57.1 
 
 		 649 aa  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 		 651 aa  685    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  55.99 
 
 		 640 aa  703    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  53.01 
 
 		 645 aa  650    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  57.88 
 
 		 769 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.1 
 
 		 650 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.14 
 
 		 640 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  55.52 
 
 		 640 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 		 642 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  51.92 
 
 		 655 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 		 636 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.67 
 
 		 665 aa  685    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.1 
 
 		 635 aa  650    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.61 
 
 		 640 aa  707    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.97 
 
 		 642 aa  719    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.26 
 
 		 636 aa  676    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  51.62 
 
 		 655 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 		 636 aa  675    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 		 661 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  50.84 
 
 		 655 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  59.15 
 
 		 633 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 		 645 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 		 658 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  67.28 
 
 		 646 aa  928    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.18 
 
 		 655 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  50.54 
 
 		 661 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  56.92 
 
 		 772 aa  645    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  57.48 
 
 		 644 aa  739    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 655 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  57.5 
 
 		 637 aa  744    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  52.02 
 
 		 655 aa  666    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  57.59 
 
 		 795 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  704    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 		 645 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.52 
 
 		 650 aa  650    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 		 655 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  53.46 
 
 		 645 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.14 
 
 		 640 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 651 aa  1342    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.24 
 
 		 634 aa  698    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 		 640 aa  708    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 		 653 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  51.56 
 
 		 675 aa  692    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  57.3 
 
 		 643 aa  751    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.49 
 
 		 632 aa  754    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 633 aa  714    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  50.69 
 
 		 655 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  55.4 
 
 		 650 aa  732    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.68 
 
 		 640 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.07 
 
 		 644 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.74 
 
 		 644 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  703    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.11 
 
 		 640 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  75.04 
 
 		 652 aa  1021    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  55.76 
 
 		 638 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 638 aa  695    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 		 649 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  59 
 
 		 638 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.61 
 
 		 657 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  57.32 
 
 		 802 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  71.07 
 
 		 651 aa  987    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.29 
 
 		 633 aa  710    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 		 769 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  55.68 
 
 		 640 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 651 aa  679    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.31 
 
 		 634 aa  659    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 		 652 aa  650    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  57.41 
 
 		 644 aa  764    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  55.71 
 
 		 641 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.01 
 
 		 637 aa  664    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  54.8 
 
 		 642 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.7 
 
 		 650 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 796 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 		 645 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.57 
 
 		 628 aa  735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  52.66 
 
 		 641 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  57.52 
 
 		 635 aa  721    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.34 
 
 		 637 aa  679    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  58.26 
 
 		 644 aa  779    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  57.92 
 
 		 802 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  57.48 
 
 		 643 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  73.56 
 
 		 652 aa  969    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 		 640 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.19 
 
 		 656 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  51.79 
 
 		 655 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.84 
 
 		 627 aa  657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.68 
 
 		 635 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 		 769 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>