More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0029 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  48.22 
 
 		 804 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  48.22 
 
 		 804 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  47.05 
 
 		 804 aa  693    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  51.7 
 
 		 795 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  50.43 
 
 		 806 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 804 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  46.12 
 
 		 812 aa  685    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  99.35 
 
 		 769 aa  1567    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  48.52 
 
 		 805 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  45.86 
 
 		 842 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  57.07 
 
 		 807 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46.97 
 
 		 814 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  99.87 
 
 		 769 aa  1574    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  47.19 
 
 		 810 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  50.25 
 
 		 805 aa  725    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  48.97 
 
 		 805 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 769 aa  1575    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  47.35 
 
 		 809 aa  695    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  48.12 
 
 		 798 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  49.44 
 
 		 805 aa  715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  49.56 
 
 		 805 aa  717    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 805 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  48.37 
 
 		 807 aa  708    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  45.43 
 
 		 798 aa  680    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  59.08 
 
 		 633 aa  646    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0003  DNA gyrase subunit B  47.25 
 
 		 823 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  49.18 
 
 		 813 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  47.6 
 
 		 807 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  49.2 
 
 		 805 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  46.31 
 
 		 811 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  50.43 
 
 		 795 aa  744    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  46.7 
 
 		 824 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  46.79 
 
 		 851 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  50.99 
 
 		 805 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  49.88 
 
 		 795 aa  737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  50.37 
 
 		 797 aa  720    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  46.97 
 
 		 813 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  46.31 
 
 		 811 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  67.45 
 
 		 769 aa  1051    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  46.84 
 
 		 810 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  47.67 
 
 		 802 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  47.12 
 
 		 795 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  47.81 
 
 		 795 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  49.37 
 
 		 813 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 		 805 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  47.22 
 
 		 812 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  45.7 
 
 		 783 aa  653    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  44.07 
 
 		 798 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  46.02 
 
 		 805 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 804 aa  722    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  49.14 
 
 		 808 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 813 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  48.19 
 
 		 798 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  50.99 
 
 		 805 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  51.29 
 
 		 805 aa  731    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 		 632 aa  645    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 813 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  49.63 
 
 		 805 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  49.18 
 
 		 813 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  47.77 
 
 		 811 aa  688    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  48.77 
 
 		 804 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  48.14 
 
 		 802 aa  689    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 810 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 		 805 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  49.02 
 
 		 806 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 824 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  46.52 
 
 		 807 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  48.83 
 
 		 806 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  48.82 
 
 		 806 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  47.42 
 
 		 815 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  50.43 
 
 		 806 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  46.25 
 
 		 811 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  49.57 
 
 		 794 aa  727    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  49 
 
 		 807 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  50.62 
 
 		 805 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  50.81 
 
 		 805 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  48.77 
 
 		 805 aa  726    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  50.93 
 
 		 805 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.45 
 
 		 633 aa  663    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  47.11 
 
 		 800 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  46.57 
 
 		 824 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  49.08 
 
 		 806 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 824 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.09 
 
 		 628 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  48.38 
 
 		 808 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  48.32 
 
 		 812 aa  713    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  50.49 
 
 		 805 aa  727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  76.1 
 
 		 773 aa  1201    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  49.81 
 
 		 802 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  47.95 
 
 		 812 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.43 
 
 		 805 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  46.13 
 
 		 822 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  49.51 
 
 		 809 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>