More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0462 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  48.31 
 
 		 804 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  46.96 
 
 		 806 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 804 aa  1656    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  49.76 
 
 		 795 aa  753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  47.42 
 
 		 806 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  48.31 
 
 		 804 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  47.28 
 
 		 769 aa  694    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  46.97 
 
 		 807 aa  712    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  48.74 
 
 		 804 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  43.58 
 
 		 795 aa  661    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  45.67 
 
 		 842 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 		 814 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  47.2 
 
 		 769 aa  698    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  46.73 
 
 		 830 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 		 809 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  46.12 
 
 		 805 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  47.72 
 
 		 805 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3355  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 805 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  46.55 
 
 		 769 aa  689    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  47.28 
 
 		 805 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  47.4 
 
 		 805 aa  680    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  48.08 
 
 		 805 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  45.92 
 
 		 826 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 769 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0003  DNA gyrase subunit B  44.56 
 
 		 841 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  44.13 
 
 		 798 aa  659    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0003  DNA gyrase subunit B  46.15 
 
 		 823 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  48.55 
 
 		 806 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 		 807 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 805 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  49.51 
 
 		 795 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  46.33 
 
 		 824 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  49.88 
 
 		 794 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4146  DNA gyrase subunit B  45.1 
 
 		 868 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  50.25 
 
 		 795 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  48.96 
 
 		 797 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  47.42 
 
 		 813 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  47.2 
 
 		 769 aa  671    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0003  DNA gyrase, B subunit  45.45 
 
 		 859 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  44.51 
 
 		 802 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.94 
 
 		 634 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  47 
 
 		 822 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 633 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  45.17 
 
 		 814 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  47.17 
 
 		 798 aa  668    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  47.6 
 
 		 806 aa  698    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0003  DNA gyrase subunit B  46.57 
 
 		 824 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  44.02 
 
 		 798 aa  657    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  47.16 
 
 		 851 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  45.68 
 
 		 870 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  47.92 
 
 		 808 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  47.74 
 
 		 813 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  48.15 
 
 		 798 aa  710    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  47.91 
 
 		 805 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  47.6 
 
 		 810 aa  688    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  48.26 
 
 		 805 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.52 
 
 		 632 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  47.25 
 
 		 805 aa  699    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  47.66 
 
 		 805 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  48.04 
 
 		 806 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  47.42 
 
 		 806 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  45.97 
 
 		 815 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  45.94 
 
 		 802 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  44.86 
 
 		 832 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 		 807 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  46.67 
 
 		 804 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 824 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.73 
 
 		 805 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 811 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.92 
 
 		 806 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  48.15 
 
 		 805 aa  712    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  56.2 
 
 		 652 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  47.72 
 
 		 808 aa  690    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000624797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  47.86 
 
 		 805 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  0.00000387143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  48.49 
 
 		 807 aa  710    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.69 
 
 		 813 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  46.89 
 
 		 768 aa  672    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  47.82 
 
 		 805 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  48.31 
 
 		 804 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  48.12 
 
 		 813 aa  699    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  46.76 
 
 		 800 aa  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  46.49 
 
 		 824 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  47.8 
 
 		 806 aa  701    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0003  DNA gyrase, B subunit  44.9 
 
 		 868 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 824 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  57.75 
 
 		 628 aa  658    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  48.25 
 
 		 808 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  47.32 
 
 		 812 aa  683    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  46.61 
 
 		 814 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  46.05 
 
 		 773 aa  659    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  49.63 
 
 		 802 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  46.52 
 
 		 770 aa  678    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  44.96 
 
 		 812 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>