More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0003 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  46.9 
 
 		 804 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.9 
 
 		 804 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  53.32 
 
 		 804 aa  639    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  48.14 
 
 		 805 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  50.38 
 
 		 795 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  47.88 
 
 		 806 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 806 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  76.1 
 
 		 769 aa  1227    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  46.36 
 
 		 811 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  47.84 
 
 		 804 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  44.42 
 
 		 795 aa  648    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  48.51 
 
 		 805 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  48.75 
 
 		 809 aa  697    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46 
 
 		 814 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  75.97 
 
 		 769 aa  1226    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  46.57 
 
 		 810 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  48.95 
 
 		 805 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  47.76 
 
 		 805 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0003  DNA gyrase subunit B  44.17 
 
 		 877 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  47.37 
 
 		 811 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  47.97 
 
 		 812 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  48.59 
 
 		 805 aa  717    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  48.71 
 
 		 805 aa  719    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  48.01 
 
 		 805 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  46.6 
 
 		 804 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  45.03 
 
 		 832 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  44.58 
 
 		 798 aa  668    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  58.27 
 
 		 633 aa  647    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  83.75 
 
 		 770 aa  1317    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  47.97 
 
 		 813 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  48.82 
 
 		 806 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  48.03 
 
 		 807 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  47.64 
 
 		 805 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  46.36 
 
 		 811 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  50.81 
 
 		 795 aa  753    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  46.77 
 
 		 824 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  46.36 
 
 		 811 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.62 
 
 		 812 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  56.02 
 
 		 795 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  50.38 
 
 		 797 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  47.35 
 
 		 813 aa  703    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  48.05 
 
 		 798 aa  696    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  66.97 
 
 		 769 aa  1053    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  47.15 
 
 		 810 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  46.89 
 
 		 802 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  46.07 
 
 		 807 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  46.01 
 
 		 822 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  47.12 
 
 		 795 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  48.92 
 
 		 813 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  47.88 
 
 		 806 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  46.07 
 
 		 795 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  45.62 
 
 		 783 aa  661    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  43.73 
 
 		 798 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  47.06 
 
 		 805 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  44.9 
 
 		 870 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  48.41 
 
 		 808 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  48.54 
 
 		 813 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  46.88 
 
 		 798 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  79.53 
 
 		 768 aa  1238    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  49.19 
 
 		 805 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  47.53 
 
 		 814 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  48.99 
 
 		 813 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  47.91 
 
 		 805 aa  699    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  48.23 
 
 		 813 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  75.84 
 
 		 769 aa  1225    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.12 
 
 		 794 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  45.91 
 
 		 802 aa  669    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  48.51 
 
 		 804 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  45.82 
 
 		 805 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 810 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  46.29 
 
 		 824 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  48.33 
 
 		 807 aa  700    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  45.42 
 
 		 884 aa  690    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  0.0000000317646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.98 
 
 		 806 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  46.76 
 
 		 815 aa  685    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  46.53 
 
 		 804 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  45.59 
 
 		 851 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  47.89 
 
 		 807 aa  708    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  47.73 
 
 		 807 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  48.76 
 
 		 805 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  48.7 
 
 		 805 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  48.14 
 
 		 805 aa  714    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  48.58 
 
 		 805 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.91 
 
 		 633 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  46.63 
 
 		 800 aa  675    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 824 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 806 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  46.29 
 
 		 824 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.77 
 
 		 628 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  48.56 
 
 		 808 aa  698    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 		 812 aa  693    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  48.63 
 
 		 805 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 773 aa  1576    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  49.94 
 
 		 802 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  48.27 
 
 		 805 aa  699    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  46.61 
 
 		 812 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.57 
 
 		 805 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  47.21 
 
 		 805 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  47.43 
 
 		 809 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  48.52 
 
 		 805 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>