More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0005 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  58.92 
 
 		 804 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  58.92 
 
 		 804 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  58.88 
 
 		 804 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  58.57 
 
 		 642 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  62.59 
 
 		 795 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  57.43 
 
 		 654 aa  740    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  57.89 
 
 		 638 aa  749    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  56.07 
 
 		 666 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  72.11 
 
 		 643 aa  903    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  59.07 
 
 		 804 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  81.09 
 
 		 640 aa  1045    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  57.21 
 
 		 654 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  58.29 
 
 		 655 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  56.37 
 
 		 769 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  67.03 
 
 		 650 aa  871    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  54.7 
 
 		 653 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 656 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  71.68 
 
 		 640 aa  882    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  80.94 
 
 		 640 aa  1044    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  57.21 
 
 		 654 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  80.94 
 
 		 640 aa  1044    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  57.21 
 
 		 654 aa  727    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  58.49 
 
 		 635 aa  764    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  52.99 
 
 		 647 aa  663    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  80.94 
 
 		 640 aa  1046    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  57.21 
 
 		 654 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  58.64 
 
 		 642 aa  744    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  58.39 
 
 		 805 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  58.57 
 
 		 805 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  57.43 
 
 		 655 aa  741    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  60.71 
 
 		 661 aa  730    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  57.05 
 
 		 655 aa  755    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  64.35 
 
 		 633 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  62.16 
 
 		 645 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 675 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  59.71 
 
 		 807 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.83 
 
 		 795 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  58.97 
 
 		 644 aa  754    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  58.05 
 
 		 655 aa  758    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  59.75 
 
 		 637 aa  754    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  58.91 
 
 		 655 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  61.92 
 
 		 795 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  59.04 
 
 		 797 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  55.02 
 
 		 675 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  80.94 
 
 		 640 aa  1044    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  57.21 
 
 		 654 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  57.94 
 
 		 769 aa  642    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  57.84 
 
 		 655 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  61.94 
 
 		 645 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  56.58 
 
 		 634 aa  735    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  67.19 
 
 		 649 aa  849    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  68.09 
 
 		 641 aa  855    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  66.14 
 
 		 634 aa  853    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  56.37 
 
 		 651 aa  708    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  58.63 
 
 		 805 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  56.99 
 
 		 679 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  54.02 
 
 		 675 aa  716    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 		 646 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.73 
 
 		 794 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  64.98 
 
 		 632 aa  847    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  61.37 
 
 		 645 aa  743    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  58.56 
 
 		 802 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  59.18 
 
 		 879 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0546  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.73 
 
 		 711 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 675 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  62.5 
 
 		 644 aa  825    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  58.93 
 
 		 806 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  58.01 
 
 		 652 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  67.03 
 
 		 638 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  67.19 
 
 		 638 aa  822    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  59.36 
 
 		 807 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  56.9 
 
 		 655 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  59.4 
 
 		 807 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  58.71 
 
 		 805 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.57 
 
 		 633 aa  862    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  57.59 
 
 		 655 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  67.41 
 
 		 651 aa  867    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  55.87 
 
 		 644 aa  706    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  64.21 
 
 		 652 aa  831    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  53.32 
 
 		 674 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  65.99 
 
 		 655 aa  821    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  53.28 
 
 		 661 aa  662    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  64.25 
 
 		 672 aa  813    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  56.39 
 
 		 665 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  54.46 
 
 		 649 aa  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  67.23 
 
 		 650 aa  862    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  55.04 
 
 		 696 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  64.61 
 
 		 628 aa  861    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  59.71 
 
 		 808 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  58.48 
 
 		 812 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  59.22 
 
 		 655 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  56.55 
 
 		 666 aa  698    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.47 
 
 		 802 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  59.84 
 
 		 643 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  67.87 
 
 		 638 aa  875    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 		 675 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 		 719 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  55.02 
 
 		 675 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  56.37 
 
 		 769 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  58.4 
 
 		 636 aa  747    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>