More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0546 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 		 650 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.69 
 
 		 643 aa  768    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51.59 
 
 		 649 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  53.56 
 
 		 634 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0546  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 711 aa  1466    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  54.28 
 
 		 633 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  60.43 
 
 		 645 aa  751    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.01 
 
 		 628 aa  648    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 		 636 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 		 640 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  50.53 
 
 		 651 aa  626  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.57 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  48.77 
 
 		 655 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  52.57 
 
 		 635 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.37 
 
 		 651 aa  622  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.02 
 
 		 641 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  50.54 
 
 		 655 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  50.7 
 
 		 655 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  50.23 
 
 		 652 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.84 
 
 		 633 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.38 
 
 		 636 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.69 
 
 		 636 aa  618  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  51.86 
 
 		 644 aa  618  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  50.7 
 
 		 655 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  50.61 
 
 		 648 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 655 aa  615  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.74 
 
 		 675 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 632 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 644 aa  615  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 		 636 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  52.33 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.6 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  51.55 
 
 		 642 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  49.69 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 644 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.27 
 
 		 656 aa  611  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 648 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  55.02 
 
 		 636 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50.93 
 
 		 655 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 		 655 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 645 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 		 637 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.78 
 
 		 665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  51.68 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  51.86 
 
 		 649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  50.38 
 
 		 658 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  48.84 
 
 		 654 aa  599  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 		 637 aa  602  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  49.23 
 
 		 655 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  49.85 
 
 		 650 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  51.45 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 650 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  51.45 
 
 		 640 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  49.07 
 
 		 655 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.23 
 
 		 652 aa  598  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  53.09 
 
 		 655 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  51.3 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  52.73 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  47.55 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  51 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  52.58 
 
 		 641 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  51.22 
 
 		 640 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  51.22 
 
 		 640 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  52.81 
 
 		 645 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  52.58 
 
 		 641 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  51.15 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  48.8 
 
 		 647 aa  591  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  48.93 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  50.78 
 
 		 633 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  52.19 
 
 		 645 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  48.62 
 
 		 659 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.46 
 
 		 653 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  47.7 
 
 		 645 aa  592  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  49.4 
 
 		 651 aa  591  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  51.86 
 
 		 638 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  48.93 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  50.38 
 
 		 627 aa  587  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 654 aa  588  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  49.31 
 
 		 649 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  49.31 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  49.46 
 
 		 645 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  50.69 
 
 		 640 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  51.86 
 
 		 638 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  50.93 
 
 		 672 aa  585  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  48.93 
 
 		 654 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  48.94 
 
 		 643 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  48.7 
 
 		 652 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>