More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0999 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  71.38 
 
 		 674 aa  962    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  66.87 
 
 		 666 aa  875    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  53.52 
 
 		 642 aa  686    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  70.42 
 
 		 654 aa  941    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.8 
 
 		 640 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  68.21 
 
 		 653 aa  917    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  940    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  940    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  54.67 
 
 		 647 aa  699    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  940    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  53.67 
 
 		 640 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.16 
 
 		 637 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  937    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  70.42 
 
 		 654 aa  930    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  69.33 
 
 		 645 aa  920    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  937    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  54.62 
 
 		 637 aa  670    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  940    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  55.52 
 
 		 643 aa  694    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  66.36 
 
 		 665 aa  879    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  66.36 
 
 		 663 aa  878    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  70.27 
 
 		 654 aa  940    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  70.42 
 
 		 654 aa  941    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.35 
 
 		 633 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  70.64 
 
 		 644 aa  931    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  68.66 
 
 		 674 aa  886    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 661 aa  1357    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  68.33 
 
 		 687 aa  882    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  69.15 
 
 		 649 aa  904    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  51.83 
 
 		 628 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  70.74 
 
 		 656 aa  945    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  70.42 
 
 		 654 aa  930    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.24 
 
 		 650 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.48 
 
 		 641 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.39 
 
 		 638 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  53.72 
 
 		 633 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.23 
 
 		 638 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  53.28 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 		 632 aa  626  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  51.26 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  51.94 
 
 		 645 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.19 
 
 		 637 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.91 
 
 		 647 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  51.34 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 		 638 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.09 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 		 634 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.28 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  49.22 
 
 		 649 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 		 637 aa  615  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  51.81 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.13 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  51.87 
 
 		 648 aa  610  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  51.97 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.14 
 
 		 636 aa  609  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  51.81 
 
 		 640 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 		 636 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  52.13 
 
 		 635 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 		 633 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  51.41 
 
 		 649 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.66 
 
 		 638 aa  601  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.25 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  50.63 
 
 		 648 aa  602  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.13 
 
 		 636 aa  596  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  48.98 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.58 
 
 		 633 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.37 
 
 		 665 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.81 
 
 		 643 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  48.37 
 
 		 655 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  47.5 
 
 		 651 aa  587  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  47.75 
 
 		 644 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  47.34 
 
 		 654 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  49.76 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  48.46 
 
 		 655 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 		 635 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  49.39 
 
 		 652 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 		 642 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 		 652 aa  582  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 		 650 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  46.71 
 
 		 645 aa  585  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  47.03 
 
 		 652 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 641 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  48.32 
 
 		 659 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  48.38 
 
 		 658 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  47.98 
 
 		 643 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 641 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  49.37 
 
 		 650 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  48 
 
 		 655 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  46.84 
 
 		 636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>