More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0862 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 636 aa  661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  52.24 
 
 		 654 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  56.16 
 
 		 804 aa  635    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.66 
 
 		 642 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  59.75 
 
 		 795 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  71.47 
 
 		 654 aa  941    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.32 
 
 		 638 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  59.03 
 
 		 796 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  57.01 
 
 		 643 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.86 
 
 		 640 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  57.84 
 
 		 825 aa  648    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.64 
 
 		 650 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.81 
 
 		 642 aa  674    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.42 
 
 		 649 aa  646    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.61 
 
 		 636 aa  688    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.86 
 
 		 640 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.94 
 
 		 640 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  52.79 
 
 		 661 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  53.07 
 
 		 655 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.59 
 
 		 633 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 645 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 656 aa  651    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.59 
 
 		 633 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  61.34 
 
 		 644 aa  783    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  54.36 
 
 		 655 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  61.02 
 
 		 637 aa  773    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  54.45 
 
 		 655 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  59.71 
 
 		 795 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.74 
 
 		 635 aa  674    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.96 
 
 		 642 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  53.64 
 
 		 655 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  55.26 
 
 		 645 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 		 675 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 641 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  54.86 
 
 		 634 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.21 
 
 		 627 aa  658    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  52.4 
 
 		 654 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 		 675 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  58.51 
 
 		 794 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  70.86 
 
 		 646 aa  950    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  54.6 
 
 		 655 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.72 
 
 		 636 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.24 
 
 		 632 aa  730    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 		 658 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.81 
 
 		 638 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  58.42 
 
 		 879 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  57.17 
 
 		 640 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  56.49 
 
 		 641 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  56.09 
 
 		 640 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 		 675 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.75 
 
 		 644 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  70.81 
 
 		 651 aa  955    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  74.03 
 
 		 652 aa  986    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  57.3 
 
 		 638 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  57.46 
 
 		 638 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.96 
 
 		 640 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.82 
 
 		 633 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  52.24 
 
 		 654 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  51.11 
 
 		 675 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 651 aa  683    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  60 
 
 		 644 aa  787    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  52.32 
 
 		 652 aa  649    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.01 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  58.84 
 
 		 802 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  57.63 
 
 		 644 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  61.84 
 
 		 643 aa  798    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.25 
 
 		 650 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  50.6 
 
 		 696 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  57.1 
 
 		 635 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  56.13 
 
 		 628 aa  726    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  59.97 
 
 		 644 aa  798    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  60.81 
 
 		 649 aa  789    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.16 
 
 		 665 aa  668    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 		 645 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  61.37 
 
 		 643 aa  793    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.19 
 
 		 651 aa  659    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  51.25 
 
 		 675 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  50.44 
 
 		 675 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 		 653 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  52.86 
 
 		 654 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  52.66 
 
 		 645 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.14 
 
 		 634 aa  636    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 		 640 aa  714    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  54.75 
 
 		 655 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 		 655 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.07 
 
 		 655 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.53 
 
 		 655 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  57.17 
 
 		 640 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>